げんかく‐せいぶつ【原核生物】
原核生物
細菌のように、細胞内に核を持たない生物。核を持つ生物は真核生物という。, 細菌のように、細胞内に核を持たない細胞。核を持つ細胞を真核細胞という。
原核細胞
原核生物 [Procaryote(s)]
原核生物
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2024/04/08 09:11 UTC 版)
原核生物（げんかくせいぶつ、英: prokaryote, or procaryote[1]）は、核や他の膜結合細胞小器官を持たない単細胞生物である[2]。原核生物という用語は、古代ギリシア語の πρό (pró)「前」と κάρυον (káruon)「仁、核」に由来する[3][4]。エドゥアール・シャットンの研究に基づく2帝系では、原核生物は原核生物帝（Prokaryota）に分類されていた[5]。しかし、分子的分析に基づく3ドメイン系では、原核生物は 細菌（Bacteria、旧: Eubacteria）と古細菌（Archaea、旧: Archaebacteria）の2つのドメインに分けられる。細胞核（核）を持つ生物は、第3のドメインである真核生物（Eukaryota or Eucarya）に位置づけられる[6]。
- ^ “Definition of PROCARYOTE” (英語). www.merriam-webster.com. 2023年12月30日閲覧。
- ^ a b NC State University. “Prokaryotes: Single-celled Organisms”. 2014年8月6日閲覧。
- ^ a b c d Campbell, N. "Biology:Concepts & Connections". Pearson Education. San Francisco: 2003.
- ^ “prokaryote”. Online Etymology Dictionary. 2013年5月23日閲覧。
- ^ Sapp, J. (2005). “The Prokaryote-Eukaryote Dichotomy: Meanings and Mythology”. Microbiology and Molecular Biology Reviews 69 (2): 292–305. doi:10.1128/MMBR.69.2.292-305.2005. PMC 1197417. PMID 15944457.
- ^ Coté, Gary; De Tullio, Mario (2010). “Beyond Prokaryotes and Eukaryotes: Planctomycetes and Cell Organization”. Nature.
- ^ Kerfeld CA, Sawaya MR, Tanaka S, Nguyen CV, Phillips M, Beeby M, Yeates TO (August 2005). “Protein structures forming the shell of primitive bacterial organelles”. Science 309 (5736): 936–8. Bibcode: 2005Sci...309..936K. doi:10.1126/science.1113397. PMID 16081736.
- ^ Murat D, Byrne M, Komeili A (October 2010). “Cell biology of prokaryotic organelles”. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology 2 (10): a000422. doi:10.1101/cshperspect.a000422. PMC 2944366. PMID 20739411.
- ^ Murat, Dorothee; Byrne, Meghan; Komeili, Arash (2010-10-01). “Cell Biology of Prokaryotic Organelles”. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology 2 (10): a000422. doi:10.1101/cshperspect.a000422. PMC 2944366. PMID 20739411.
- ^ Kaiser D (October 2003). “Coupling cell movement to multicellular development in myxobacteria”. Nature Reviews. Microbiology 1 (1): 45–54. doi:10.1038/nrmicro733. PMID 15040179.
- ^ Sung KH, Song HK (July 22, 2014). “Insights into the molecular evolution of HslU ATPase through biochemical and mutational analyses”. PLOS ONE 9 (7): e103027. Bibcode: 2014PLoSO...9j3027S. doi:10.1371/journal.pone.0103027. PMC 4106860. PMID 25050622.
- ^ Stanier RY, Van Niel CB (1962). “The concept of a bacterium”. Archiv für Mikrobiologie 42 (1): 17–35. doi:10.1007/BF00425185. PMID 13916221.
- ^ Chatton, Édouard (1937). Titres Et Travaux Scientifiques (1906-1937) De Edouard Chatton. Sète: Impr. E. Sottano.
- ^ Bauman RW, Tizard IR, Machunis-Masouka E (2006). Microbiology. San Francisco: Pearson Benjamin Cummings. ISBN 978-0-8053-7693-7
- ^ Stoeckenius W (October 1981). “Walsby's square bacterium: fine structure of an orthogonal procaryote”. Journal of Bacteriology 148 (1): 352–60. doi:10.1128/JB.148.1.352-360.1981. PMC 216199. PMID 7287626.
- ^ Chen I, Dubnau D (March 2004). “DNA uptake during bacterial transformation”. Nature Reviews. Microbiology 2 (3): 241–9. doi:10.1038/nrmicro844. PMID 15083159.
- ^ Solomon JM, Grossman AD (April 1996). “Who's competent and when: regulation of natural genetic competence in bacteria”. Trends in Genetics 12 (4): 150–5. doi:10.1016/0168-9525(96)10014-7. PMID 8901420.
- ^ Akamatsu T, Taguchi H (April 2001). “Incorporation of the whole chromosomal DNA in protoplast lysates into competent cells of Bacillus subtilis”. Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 65 (4): 823–9. doi:10.1271/bbb.65.823. PMID 11388459.
- ^ Saito Y, Taguchi H, Akamatsu T (March 2006). “Fate of transforming bacterial genome following incorporation into competent cells of Bacillus subtilis: a continuous length of incorporated DNA”. Journal of Bioscience and Bioengineering 101 (3): 257–62. doi:10.1263/jbb.101.257. PMID 16716928.
- ^ Johnsborg O, Eldholm V, Håvarstein LS (December 2007). “Natural genetic transformation: prevalence, mechanisms and function”. Research in Microbiology 158 (10): 767–78. doi:10.1016/j.resmic.2007.09.004. PMID 17997281.
- ^ Rosenshine I, Tchelet R, Mevarech M (September 1989). “The mechanism of DNA transfer in the mating system of an archaebacterium”. Science 245 (4924): 1387–9. Bibcode: 1989Sci...245.1387R. doi:10.1126/science.2818746. PMID 2818746.
- ^ Fröls S, Ajon M, Wagner M, Teichmann D, Zolghadr B, Folea M, Boekema EJ, Driessen AJ, Schleper C, Albers SV (November 2008). “UV-inducible cellular aggregation of the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus solfataricus is mediated by pili formation”. Molecular Microbiology 70 (4): 938–52. doi:10.1111/j.1365-2958.2008.06459.x. PMID 18990182.
- ^ Madigan T (2012). Brock biology of microorganisms (13th ed.). San Francisco: Benjamin Cummings. ISBN 9780321649638
- ^ Costerton, J. William (2007). “Direct Observations”. The Biofilm Primer. Springer Series on Biofilms. 1. Berlin, Heidelberg: Springer. pp. 3–4. doi:10.1007/978-3-540-68022-2_2. ISBN 978-3-540-68021-5
- ^ Costerton JW, Lewandowski Z, Caldwell DE, Korber DR, Lappin-Scott HM (October 1995). “Microbial biofilms”. Annual Review of Microbiology 49 (1): 711–45. doi:10.1146/annurev.mi.49.100195.003431. PMID 8561477.
- ^ Shapiro JA (1998). “Thinking about bacterial populations as multicellular organisms”. Annual Review of Microbiology 52 (1): 81–104. doi:10.1146/annurev.micro.52.1.81. PMID 9891794. オリジナルの2011-07-17時点におけるアーカイブ。.
- ^ Chua SL, Liu Y, Yam JK, Chen Y, Vejborg RM, Tan BG, Kjelleberg S, Tolker-Nielsen T, Givskov M, Yang L (July 2014). “Dispersed cells represent a distinct stage in the transition from bacterial biofilm to planktonic lifestyles”. Nature Communications 5 (1): 4462. Bibcode: 2014NatCo...5.4462C. doi:10.1038/ncomms5462. PMID 25042103.
- ^ Hamilton WD (July 1964). “The genetical evolution of social behaviour. II”. Journal of Theoretical Biology 7 (1): 17–52. Bibcode: 1964JThBi...7...17H. doi:10.1016/0022-5193(64)90039-6. PMID 5875340.
- ^ Balaban N, Ren D, Givskov M, Rasmussen TB (2008). “Introduction”. Control of Biofilm Infections by Signal Manipulation. Springer Series on Biofilms. 2. Berlin, Heidelberg: Springer. pp. 1–11. doi:10.1007/7142_2007_006. ISBN 978-3-540-73852-7
- ^ Costerton JW, Stewart PS, Greenberg EP (May 1999). “Bacterial biofilms: a common cause of persistent infections”. Science 284 (5418): 1318–22. Bibcode: 1999Sci...284.1318C. doi:10.1126/science.284.5418.1318. PMID 10334980.
- ^ Egel R (January 2012). “Primal eukaryogenesis: on the communal nature of precellular States, ancestral to modern life”. Life 2 (1): 170–212. Bibcode: 2012Life....2..170E. doi:10.3390/life2010170. PMC 4187143. PMID 25382122.
- ^ Zimmer C (August 2009). “Origins. On the origin of eukaryotes”. Science 325 (5941): 666–8. doi:10.1126/science.325_666. PMID 19661396.
- ^ Brown JR (February 2003). “Ancient horizontal gene transfer”. Nature Reviews. Genetics 4 (2): 121–32. doi:10.1038/nrg1000. PMID 12560809.
- ^ Forterre P, Philippe H (October 1999). “Where is the root of the universal tree of life?”. BioEssays 21 (10): 871–9. doi:10.1002/(SICI)1521-1878(199910)21:10<871::AID-BIES10>3.0.CO;2-Q. PMID 10497338.
- ^ Poole A, Jeffares D, Penny D (October 1999). “Early evolution: prokaryotes, the new kids on the block”. BioEssays 21 (10): 880–9. doi:10.1002/(SICI)1521-1878(199910)21:10<880::AID-BIES11>3.0.CO;2-P. PMID 10497339.
- ^ Woese C (June 1998). “The universal ancestor”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 95 (12): 6854–9. Bibcode: 1998PNAS...95.6854W. doi:10.1073/pnas.95.12.6854. PMC 22660. PMID 9618502.
- ^ Martin, William (2005). “Woe is the Tree of Life”. In Sapp, Jan. Microbial Phylogeny and Evolution: Concepts and Controversies. Oxford: Oxford University Press. pp. 139
- ^ Carl Woese, J Peter Gogarten, "When did eukaryotic cells (cells with nuclei and other internal organelles) first evolve? What do we know about how they evolved from earlier life-forms?" Scientific American, October 21, 1999.
- ^ McSween HY (July 1997). “Evidence for life in a martian meteorite?”. GSA Today 7 (7): 1–7. PMID 11541665.
- ^ McKay DS, Gibson EK, Thomas-Keprta KL, Vali H, Romanek CS, Clemett SJ, Chillier XD, Maechling CR, Zare RN (August 1996). “Search for past life on Mars: possible relic biogenic activity in martian meteorite ALH84001”. Science 273 (5277): 924–30. Bibcode: 1996Sci...273..924M. doi:10.1126/science.273.5277.924. PMID 8688069.
- ^ Crenson, Matt (2006年8月6日). “After 10 years, few believe life on Mars”. Associated Press (on space.com]). 2006年8月9日時点のオリジナルよりアーカイブ。2006年8月6日閲覧。
- ^ Scott ER (February 1999). “Origin of carbonate-magnetite-sulfide assemblages in Martian meteorite ALH84001”. Journal of Geophysical Research 104 (E2): 3803–13. Bibcode: 1999JGR...104.3803S. doi:10.1029/1998JE900034. PMID 11542931.
- ^ Hogan CM (2010). “Extremophile”. Encyclopedia of Earth. National Council of Science & the Environment
- ^ Cobián Güemes, Ana Georgina; Youle, Merry; Cantú, Vito Adrian; Felts, Ben; Nulton, James; Rohwer, Forest (2016-09-29). “Viruses as Winners in the Game of Life”. Annual Review of Virology (Annual Reviews) 3 (1): 197–214. doi:10.1146/annurev-virology-100114-054952. ISSN 2327-056X. PMID 27741409.
- ^ Woese CR (March 1994). “There must be a prokaryote somewhere: microbiology's search for itself”. Microbiological Reviews 58 (1): 1–9. doi:10.1128/MMBR.58.1.1-9.1994. PMC 372949. PMID 8177167.
- ^ Sapp J (June 2005). “The prokaryote-eukaryote dichotomy: meanings and mythology”. Microbiology and Molecular Biology Reviews 69 (2): 292–305. doi:10.1128/MMBR.69.2.292-305.2005. PMC 1197417. PMID 15944457.
- ^ a b Hug, Laura A.; Baker, Brett J.; Anantharaman, Karthik; Brown, Christopher T.; Probst, Alexander J.; Castelle, Cindy J.; Butterfield, Cristina N.; Hernsdorf, Alex W. et al. (2016-04-11). “A new view of the tree of life” (英語). Nature Microbiology 1 (5): 1–6. doi:10.1038/nmicrobiol.2016.48. ISSN 2058-5276.
- ^ Bruce Alberts (2002). The Molecular Biology of the Cell (fourth ed.). Garland Science. pp. 808. ISBN 0-8153-3218-1
- ^ Thanbichler M, Wang SC, Shapiro L (October 2005). “The bacterial nucleoid: a highly organized and dynamic structure”. Journal of Cellular Biochemistry 96 (3): 506–21. doi:10.1002/jcb.20519. PMID 15988757.
- ^ Johnston C, Caymaris S, Zomer A, Bootsma HJ, Prudhomme M, Granadel C, Hermans PW, Polard P, Martin B, Claverys JP (2013). “Natural genetic transformation generates a population of merodiploids in Streptococcus pneumoniae”. PLOS Genetics 9 (9): e1003819. doi:10.1371/journal.pgen.1003819. PMC 3784515. PMID 24086154.
- ^ Harold FM (June 1972). “Conservation and transformation of energy by bacterial membranes”. Bacteriological Reviews 36 (2): 172–230. doi:10.1128/MMBR.36.2.172-230.1972. PMC 408323. PMID 4261111.
- ^ Shih YL, Rothfield L (September 2006). “The bacterial cytoskeleton”. Microbiology and Molecular Biology Reviews 70 (3): 729–54. doi:10.1128/MMBR.00017-06. PMC 1594594. PMID 16959967.
- ^ Michie KA, Löwe J (2006). “Dynamic filaments of the bacterial cytoskeleton”. Annual Review of Biochemistry 75 (1): 467–92. doi:10.1146/annurev.biochem.75.103004.142452. PMID 16756499. オリジナルのNovember 17, 2006時点におけるアーカイブ。.
- ^ Fuerst JA (2005). “Intracellular compartmentation in planctomycetes”. Annual Review of Microbiology 59 (1): 299–328. doi:10.1146/annurev.micro.59.030804.121258. PMID 15910279.
- ^ Santarella-Mellwig R, Pruggnaller S, Roos N, Mattaj IW, Devos DP (2013). “Three-dimensional reconstruction of bacteria with a complex endomembrane system”. PLOS Biology 11 (5): e1001565. doi:10.1371/journal.pbio.1001565. PMC 3660258. PMID 23700385.
- ^ a b c Castelle CJ, Banfield JF (March 2018). “Major New Microbial Groups Expand Diversity and Alter our Understanding of the Tree of Life”. Cell 172 (6): 1181–1197. doi:10.1016/j.cell.2018.02.016. PMID 29522741.
- ^ a b Lake, J A; Henderson, E; Oakes, M; Clark, M W (1984-06). “Eocytes: a new ribosome structure indicates a kingdom with a close relationship to eukaryotes.” (英語). Proceedings of the National Academy of Sciences 81 (12): 3786–3790. doi:10.1073/pnas.81.12.3786. ISSN 0027-8424.
- ^ Cavalier-Smith T (March 2002). “The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 2): 297–354. doi:10.1099/00207713-52-2-297. PMID 11931142.
- ^ Barry ER, Bell SD (December 2006). “DNA replication in the archaea”. Microbiology and Molecular Biology Reviews 70 (4): 876–87. doi:10.1128/MMBR.00029-06. PMC 1698513. PMID 17158702.
- ^ Lane N (2015). The Vital Question – Energy, Evolution, and the Origins of Complex Life. W. W. Norton. p. 77. ISBN 978-0-393-08881-6
- ^ Forterre, Patrick (2006). “Three RNA cells for ribosomal lineages and three DNA viruses to replicate their genomes: A hypothesis for the origin of cellular domain”. PNAS 103 (10): 3669–3674. Bibcode: 2006PNAS..103.3669F. doi:10.1073/pnas.0510333103. PMC 1450140. PMID 16505372.
原核生物
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2022/01/02 14:05 UTC 版)
Judicial Opinion 15によって、以下の例外が認められている。
※この「原核生物」の解説は、「科 (分類学)」の解説の一部です。
「原核生物」を含む「科 (分類学)」の記事については、「科 (分類学)」の概要を参照ください。
原核生物
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/01/04 05:17 UTC 版)
細菌のポリソームではリボソームが二列に並んだ構造が形成されることが知られている。この配置では、リボソームは小サブユニットを介して互いに接触する。こうした二列構造は一般的に正弦波型（sinusoidal、もしくはジグザグ型）またはらせん型（3-D helical）の経路をとる。正弦波型構造では、小サブユニット間には"top-to-top"型と"top-to-bottom"型の2つのタイプの接触がみられる。らせん型構造では、"top-to-top"型の接触のみが観察される。 ポリソームは古細菌にも存在するが、その構造については多くが未解明である。
※この「原核生物」の解説は、「ポリソーム」の解説の一部です。
「原核生物」を含む「ポリソーム」の記事については、「ポリソーム」の概要を参照ください。
原核生物
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/05/08 05:17 UTC 版)
「ユビキチン様タンパク質」の記事における「原核生物」の解説
真核生物と比較して、原核生物のタンパク質とUBLとの系統学的関係性は限られたものである。放線菌の一部にはPup（英語版）（prokaryotic ubiquitin-like protein）と呼ばれるタンパク質が存在しており、プロテアソームによる分解のためにタンパク質を標識する点でユビキチンと機能的に類似している。しかしながら、これらは天然変性タンパク質であり、UBLとの進化的関係性は不明である。近年では、一部のグラム陰性菌系統でもUBact（英語版）と呼ばれる同様のタンパク質が記載されている。対照的に、テルムス属Thermusの細菌にはTtuBと呼ばれる、真核生物のUBLと共通したβ-graspフォールドを持つタンパク質が存在する。TtuBは硫黄のキャリアタンパク質と、タンパク質の共有結合修飾という二重の機能を持つことが報告されている。古細菌では、SAMP（small archaeal modifier protein）と呼ばれるβ-graspフォールドタンパク質が存在し、タンパク質分解においてユビキチンに似た役割を果たしていることが示されている。2011年に同定された未培養古細菌では真核生物のユビキチン経路に対応すると思われる完全な遺伝子セットが同定されており、ユーリアーキオータ、クレンアーキオータ、アイグアーキオータ（英語版）の少なくとも3つの系統には同様のシステムが存在すると考えられている。さらに、一部の病原性細菌は真核生物のUBL経路を模倣するタンパク質を進化させており、宿主細胞のUBLと相互作用してシグナル伝達機能に干渉する。
※この「原核生物」の解説は、「ユビキチン様タンパク質」の解説の一部です。
「原核生物」を含む「ユビキチン様タンパク質」の記事については、「ユビキチン様タンパク質」の概要を参照ください。
原核生物
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/12/19 05:08 UTC 版)
バクテリア（およびおそらく他の原核生物）は、バクテリオファージ等の病原体から身を守る為に、制限修飾系と呼ばれる独自の防御機構を利用している。このシステムでは、バクテリアは制限酵素と呼ばれる酵素を産生し、侵入してきたバクテリオファージのウイルスDNAの特定領域を攻撃して破壊する。宿主自身のDNAをメチル化する事で、「自己」である事を示し、エンドヌクレアーゼによる攻撃を防ぐ事が出来る。制限酵素と制限修飾系は、原核生物にのみ存在する。
※この「原核生物」の解説は、「自然免疫系」の解説の一部です。
「原核生物」を含む「自然免疫系」の記事については、「自然免疫系」の概要を参照ください。
原核生物
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2022/04/15 15:57 UTC 版)
原核生物における非相同組換えによる遺伝子配列の変異は真核生物とは異なる形で行われるが、その1つが欠失である。欠失変異では、非相同組換えによって遺伝子配列の連続した断片が除去される。こうした変異はファージの誘発後に高頻度で生じる。原核生物における非相同組換えの他の形態は、ゲノムの重複変異である。この場合、親ゲノムの一部がゲノムへ複数回挿入される。この重複変異は相同性に基づかずに行われるため、元の断片と同じ向きで挿入される場合も反対向きに挿入される場合もある。
※この「原核生物」の解説は、「非相同組換え」の解説の一部です。
「原核生物」を含む「非相同組換え」の記事については、「非相同組換え」の概要を参照ください。
原核生物
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/09/27 16:40 UTC 版)
原核生物では、コリプレッサーという語はリプレッサータンパク質を活性化するリガンドに対して用いられる。例えば、大腸菌Escherichia coliのトリプトファンリプレッサー（英語版）（TrpR）は、コリプレッサーであるトリプトファンが結合した時にのみDNAに結合し、trpオペロン（英語版）の転写を抑制することができる。トリプトファンが結合していないTrpRはアポリプレッサーと呼ばれ、遺伝子の転写を抑制する活性はない。trpオペロンはトリプトファンの合成を担う酵素をコードしている。そのため、TrpRはトリプトファンの生合成を調節するネガティブフィードバック機構を構成する。すなわち、トリプトファンは自身の生合成のコリプレッサーとして作用する。
※この「原核生物」の解説は、「コリプレッサー」の解説の一部です。
「原核生物」を含む「コリプレッサー」の記事については、「コリプレッサー」の概要を参照ください。
原核生物
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/12/18 09:44 UTC 版)
「DNAミスマッチ修復」の記事における「原核生物」の解説
原核生物ではDNAのメチル化を頼りに、新しく複製されたDNA(未メチル化)と元からあるDNA(既メチル化)を区別し、MutHタンパク質が新生鎖のバックボーン（糖とリン酸からなるDNAの骨格）に切れ目（ニック）を入れ、新生鎖と鋳型鎖の区別をしている。
※この「原核生物」の解説は、「DNAミスマッチ修復」の解説の一部です。
「原核生物」を含む「DNAミスマッチ修復」の記事については、「DNAミスマッチ修復」の概要を参照ください。
原核生物
「原核生物」の例文・使い方・用例・文例
原核生物と同じ種類の言葉
- 原核生物のページへのリンク
