日本の淡水魚一覧とは？わかりやすく解説

この項では、日本の淡水魚について記す。一時的淡水魚も含めるが、河川河口域まではいるものにする。干潟やマングローブ林などの汽水域も含む。外来種、変種、雑種も含む。種の下の位（亜種、変種）がある場合は、その種は含まない。和名は一般的なものにする。目・亜目・科のソート順はEschmeyer's Catalog of Fishesに準した^[1]。

凡例

記号

【外】・・・外来種
【絶】・・・絶滅種
【亜】・・・亜種
【変】・・・変種
【沖】・・・沖縄（琉球諸島）固有種
【北】・・・北海道固有種
【小】・・・小笠原固有種
【琵】・・・琵琶湖固有種
【固】・・・その他固有種

階級

括弧なし→絶対にある階級
括弧あり→一部にある階級

1…目
（2…亜目、上科）
3…科
（4…亜科）
5…属
6…種、雑種
（7…亜種、変種）
（8…変種）

分類

ヤツメウナギ目^[2]

ヤツメウナギ科

カワヤツメ属
- ウチワスナヤツメ
- カワヤツメ
- キタスナヤツメ
- シベリアヤツメ【北】
- ミナミスナヤツメ
ミツバヤツメ属
- ミツバヤツメ

チョウザメ目^[3]

チョウザメ科

チョウザメ属
- ミカドチョウザメ【国内では絶】
ダウリアチョウザメ属
- ダウリアチョウザメ【国内では絶】

ガー目^[4]

ガー科

レピソステウス属（学名：Lepisosteus）
- スポッテッドガー【外】
アトラクトステウス属（学名：Atractosteus）
- アリゲーターガー【外】

カライワシ目

イセゴイ科

イセゴイ属
- イセゴイ

ウナギ目

ウンブキアナゴ

ウナギ亜目

ウナギ科

ウツボ亜目

ウツボ科

コクハンカワウツボ
ナミダカワウツボ

アナゴ亜目

ウミヘビ科

カワウミヘビ

ニシン目

ニシン亜目

カタクチイワシ科

エツ亜科

エツ属
- エツ
  - エツ【亜】

コイ目

ドジョウ亜目

アユモドキ科

アユモドキ属
- アユモドキ【固】

ドジョウ科

ドジョウ属
- ドジョウ
  - ドジョウ在来系統
  - ドジョウ外来系統
- キタドジョウ
  - ジンダイドジョウ【絶滅か？】【固】
- ヒョウモンドジョウ
- シノビドジョウ【固】
- カラドジョウ【外】
シマドジョウ属
- オオシマドジョウ【固】
- ニシシマドジョウ【固】
- ヒガシシマドジョウ【固】
- トサシマドジョウ【固】
- ヤマトシマドジョウ【固】
- オオヨドシマドジョウ【固】
- オオガタスジシマドジョウ【琵】
- コガタスジシマドジョウ【固】
  - サンヨウコガタスジシマドジョウ【亜】
  - トウカイコガタスジシマドジョウ【亜】
  - ビワコガタスジシマドジョウ【琵】【亜】
  - ヨドコガタスジシマドジョウ【絶滅か？】【亜】
  - サンインコガタスジシマドジョウ【亜】
- ナミスジシマドジョウ【固】
  - チュウガタスジシマドジョウ【亜】
  - オンガスジシマドジョウ【亜】
  - ハカタスジシマドジョウ【亜】
- アリアケスジシマドジョウ【固】
- タンゴスジシマドジョウ【固】
- イシドジョウ【固】
- ヒナイシドジョウ【固】
- アジメドジョウ【固】

フクドジョウ科

ホトケドジョウ属
- ホトケドジョウ【固】
- エゾホトケドジョウ【固】
- ヒメドジョウ【外】
- ナガレホトケドジョウ【固】
- トウカイナガレホトケドジョウ【固】
- レイホクホトケドジョウ【固】
フクドジョウ属
- フクドジョウ【北】

コイ亜目

クセノキプリス科

ハクレン属
- ハクレン【外】
- コクレン【外】
ソウギョ属
- ソウギョ【外】
アオウオ属
- アオウオ【外】
ワタカ属
- ワタカ【琵】
ヘミクルター属
- カワイワシ【外】
メガロブラマ属
- ダントウボウ【外】
カワムツ属
- ヌマムツ【固】
- カワムツ
ハス属
- オイカワ
- ハス【亜】
カワバタモロコ属
- カワバタモロコ【固】
ヒナモロコ属
- ヒナモロコ
- キクチヒナモロコ【外】

ウグイ
マルタ
- マルタ【亜】
- ジュウサンウグイ【亜】
ウケクチウグイ【固】
エゾウグイ

アブラハヤ属

ヤチウグイ【北】
アブラハヤ
- アブラハヤ【亜】
- ヤマナカハヤ【亜】
タカハヤ

ピメファレス属

ファットヘッドミノー【外】

テンチ科

テンチ属

テンチ【外】

ダニオ科（ラスボラ科）

ダニオ属

ゼブラダニオ（ゼブラフィッシュ）【外】
パールダニオ【外】

ナマズ目

Loricarioidei

カリクティス科

コリドラス・アエネウス【外】

ロリカリア科

マダラロリカリア【外】

ナマズ亜目

ギギ科

ギギ【固】
ネコギギ【固】
アリアケギバチ【固】
ギバチ【固】

アカザ科

アカザ

ナマズ科

ナマズ属
- ナマズ（ニホンナマズ）
- イワトコナマズ【琵】
- ビワコオオナマズ【琵】
- タニガワナマズ【固】

アメリカナマズ科

ヒレナマズ【外】
アメリカナマズ（チャネルキャットフィッシュ）【外】

サケ目

サケ科

タイヘイヨウサケ属(サケ属、オンコリンクス属)
- シロサケ
- ギンザケ
- カラフトマス
- ベニザケ
  - ヒメマス【変】
- クニマス
  - クチグロマス【絶】
- ニジマス（レインボートラウト）【外】
  - スチールヘッド（テツ）【変】
- サクラマス
  - サクラマス【亜】
    - ヤマメ【変】
  - サツキマス【亜】
    - アマゴ【変】
    - イワメ【変】
- ビワマス【亜】
- マスノスケ（キングサーモン）
イトウ属
- イトウ
イワナ属（サルベリヌス属）
- イワナ
  - ニッコウイワナ【亜】
  - ヤマトイワナ【亜】
    - キリクチ【変】
  - アメマス【亜】
    - エゾイワナ【変】
  - ゴギ【亜】
- オショロコマ
  - オショロコマ【亜】
    - 降海型オショロコマ【変】
  - ミヤベイワナ【亜】
- カワマス【外】（ブルックトラウト）
- レイクトラウト【外】
シロマス属(コレゴヌス属、ワカソ属)
- マレーナ（シナノユキマス）【外】
- ペレッド（シナノユキマス）【外】
タイセイヨウサケ属(サルモ属)
- ブラウントラウト（チャマス）【外】

キュウリウオ目

キュウリウオ科

キュウリウオ属
- ワカサギ
- チシマワカサギ
- イシカリワカサギ
- チカ
- シシャモ【北】
- キュウリウオ【北】

アユ科

アユ属
- アユ
  - アユ【亜】
  - コアユ【亜】【琵】
  - リュウキュウアユ【亜】【奄美・沖縄で一部絶滅】

シラウオ科

シラウオ属
- シラウオ
- イシカワシラウオ
- アリアケシラウオ
- アリアケヒメシラウオ

ハゼ目

ツバサハゼ科

ツバサハゼ属
- ツバサハゼ

ドンコ科

ドンコ属

ドンコ
イシドンコ
「山陰・琵琶・伊勢」産ドンコ（仮）
「東瀬戸」産ドンコ（仮）
「西瀬戸」産ドンコ（仮）
「西九州」産ドンコ（仮）
ヨコシマドンコ【外】

カワアナゴ科 Eleotridae

カワアナゴ属 Eleotris
タナゴモドキ属
- タナゴモドキ
タメトモハゼ属
- タメトモハゼ
- ゴシキタメトモハゼ

ノコギリハゼ亜科

ノコギリハゼ属

ヤエヤマノコギリハゼ

ジャノメハゼ属

ジャノメハゼ

ホシマダラハゼ属

ホシマダラハゼ

オクスデルケス科

オキスデルシス亜科

トビハゼ属

イレズミハゼ属

イレズミハゼ【沖】
ツムギハゼ【沖】
フタゴハゼ【沖】

インコハゼ属

インコハゼ

ワラスボ亜科

チワラスボ属 en:Taenioides
- チワラスボ en:Taenioides cirratus
- ヒゲワラスボ
ワラスボ属 en:Odontamblyopus
- ワラスボ

ゴビオネルス亜科

マハゼ属
- マハゼ
- ハゼクチ
- アシシロハゼ
- ミナミアシシロハゼ【沖】
ヌエハゼ属
- ヌエハゼ
キヌバリ属
- ダイミョウハゼ
ヒナハゼ属
- ヒナハゼ
- タスキヒナハゼ
ゴマハゼ属
- ゴマハゼ
- ミツボシゴマハゼ
- マングローブゴマハゼ
アベハゼ属
- アベハゼ
- イズミハゼ
- ナミハゼ
- タヌキハゼ
- ムジナハゼ
- ホホグロハゼ
ノボリハゼ属
- ノボリハゼ
- クチサケハゼ
ヨシノボリ属
- ゴクラクハゼ
- カワヨシノボリ
- トウカイヨシノボリ【固】
- シマヨシノボリ
- ルリヨシノボリ
- クロヨシノボリ
- キバラヨシノボリ【沖】
- パイヌキバラヨシノボリ【沖】
  - イリオモテパイヌキバラヨシノボリ【沖】【亜】
  - イシガキパイヌキバラヨシノボリ【沖】【亜】
- ヤイマヒラヨシノボリ【沖】
- ケンムンヒラヨシノボリ【沖】
- オオヨシノボリ
- オガサワラヨシノボリ【小】
- アヤヨシノボリ【沖】
- アオバラヨシノボリ【沖】
- トウヨシノボリ
  - 大型種
    - カズサヨシノボリ【変】【固】
    - オウミヨシノボリ【変】【固】
  - 小型種
- クロダハゼ【固】
- シマヒレヨシノボリ
- ビワヨシノボリ【琵】
チチブ属
ウキゴリ属
- ウキゴリ
- スミウキゴリ
- シマウキゴリ
- イサザ
- エドハゼ
- ジュズカケハゼ
- ムサシノジュズカケハゼ
- コシノハゼ
- ホクリクジュズカケハゼ
- シンジコハゼ
- ビリンゴ
- キセルハゼ
- クボハゼ
- チクゼンハゼ
ミミズハゼ属
- ミミズハゼ
- イドミミズハゼ
- オオミミズハゼ
- ドウクツミミズハゼ
- ユウスイミミズハゼ
- ミナミヒメミミズハゼ
- ナガレミミズハゼ
- イチモンジミミズハゼ
シロウオ属
- シロウオ
ヒモハゼ属
- ホンドヒモハゼ
- イリオモテヒモハゼ
ハスジマハゼ属
- ハスジマハゼ
ハゴロモハゼ属（イトヒキハゼ属）
- ハゴロモハゼ
- オイランハゼ
サルハゼ属
- マツゲハゼ
- カマヒレマツゲハゼ
- ナガセハゼ
- ミナミサルハゼ
スナゴハゼ属
- スナゴハゼ
- マサゴハゼ
- コクチスナゴハゼ

ボウズハゼ亜科

ボウズハゼ属
- ボウズハゼ
- ルリボウズハゼ
ナンヨウボウズハゼ属
- ナンヨウボウズハゼ
- コンテリボウズハゼ
ヨロイボウズハゼ属
- ヨロイボウズハゼ
- ハヤセボウズハゼ
- アカボウズハゼ
- カエルハゼ
ミナミハゼ属
- ミナミハゼ
- クロミナミハゼ

ハゼ科

ハゼ亜科

ウロハゼ属

ウロハゼ
イワハゼ
コンジキハゼ
スダレウロハゼ

ヒトミハゼ属

ヒトミハゼ【沖】

クモハゼ属

クモハゼ
スジクモハゼ
クロホシヤハズハゼ

ヒメハゼ属

ヒメハゼ

キララハゼ属（スジハゼ属）

スジハゼ
セイタカスジハゼ【沖】
カスミハゼ【沖】
ニセツムギハゼ【沖】
ホクロハゼ

フタスジノボリハゼ属

フタスジノボリハゼ

クロコハゼ属

クロコハゼ

ツムギハゼ属

ツムギハゼ

ウチワハゼ属

ウチワハゼ

トサカハゼ属

トサカハゼ
ヒメトサカハゼ
クロトサカハゼ

サラサハゼ属

ホホベニサラサハゼ

オオメワラスボ亜科

サツキハゼ
ミヤラビハゼ
マイコハゼ

スナハゼ亜科

スナハゼ属
- スナハゼ

ヨウジウオ目

ヨウジウオ科

オオウミウマ

タウナギ目

タウナギ科

タウナギ属
- タウナギ【外】
- リュウキュウタウナギ【固】

キノボリウオ目

トウギョ科（オスフロネムス科）

ゴクラクギョ亜科

ゴクラクギョ属
- チョウセンブナ
- タイワンキンギョ

タイワンドジョウ科

タイワンドジョウ属

アジ目

カレイ科

カレイ亜科

ヌマガレイ属
- ヌマガレイ
イシガレイ属
- イシガレイ

テッポウウオ科

テッポウウオ属
- テッポウウオ

トウゴロウイワシ目

アテリノプス科

アテリノプシス亜科

オドンテステス属
- ペヘレイ（ラプラタトウゴロウ）

ダツ目

サヨリ科

メダカ科

メダカ属
- ミナミメダカ【固】
- キタノメダカ【固】

カダヤシ目

カダヤシ科

カダヤシ亜科

カダヤシ属
- カダヤシ【外】
ソードテール属
- グリーンソードテール【外】
- サザンプラティフィッシュ【外】
グッピー属
- コクチモーリー【外】
- グッピー【外】
- スリコギモーリー【外】
- Poecilia latipinna【外】

ボラ目

タカサゴイシモチ科

タカサゴイシモチ科 Ambassidae
- タカサゴイシモチ属 Ambassis
  - タカサゴイシモチ Ambassis urotaenia Bleeker, 1852 (Banded-tail glassy perchlet)

ボラ科

ボラ属

ボラ
メナダ
コボラ
ナガレフウライボラ【沖】
オニボラ【沖】
カワボラ【沖】
ヒルギメナダ
アンピンボラ

ギンポ目

スズメダイ科

ソラスズメダイ亜科

ソラスズメダイ属

スミゾメスズメダイ
リボンスズメダイ

ペルカ目

Cottoidei

カジカ科

カジカ
ウツセミカジカ
ハナカジカ
エゾハナカジカ
カンキョウカジカ
アユカケ
ヤマノカミ

Scorpaenoidei

コチ科

マゴチ
イネゴチ

Gasterosteoidei

トゲウオ科

イトヨ属
- ニホンイトヨ
- 太平洋系陸封型イトヨ
- 太平洋系降海型イトヨ
- ハリヨ
トミヨ属
- トミヨ
- エゾトミヨ【北】
- イバラトミヨ
- ムサシトミヨ
- ミナミトミヨ【絶】

サンフィッシュ目

シマイサキ亜目

ユゴイ科

ユゴイ属
- ユゴイ
- オオクチユゴイ
- トゲナガユゴイ

シマイサキ科

シマイサキ属
- シマイサキ
- コトヒキ
- ヒメコトヒキ
- ヨコシマイサキ
- ニセシマイサキ
- シミズシマイサキ

サンフィッシュ亜目

サンフィッシュ科

ブルーギル亜科

オオクチバス属（ブラックバス）
- オオクチバス【外】
- コクチバス【外】
- フロリダバス【外】
ブルーギル属
- ブルーギル【外】

ケツギョ科

オヤニラミ属
- オヤニラミ
- コウライオヤニラミ
- ナンエツオヤニラミ

ゴンベ亜目

アカメ科

アカメ属
- アカメ

ベラ目

ティラピア科（カワスズメ科）

ティラピア属
- ジルティラピア【外】
オレオクロミス属
- ナイルティラピア（イズミダイ、チカダイ）【外】
- モザンビークティラピア（カワスズメ）【外】
アルコケントルス属
- コンビクトシクリッド【外】
アストロノータス属
- オスカー【外】

ホタルジャコ目

スズキ科

スズキ属
- スズキ
- タイリクスズキ^[5]【外】

ニザダイ目

モロネ科

モロネ属
- ストライプトバス（シマスズキ）【外】
- ホワイトバス【外】

ヒメツバメウオ科

ヒメツバメウオ属
- ヒメツバメウオ

タイ科

ヘダイ亜科

クロダイ属
- クロダイ（チヌ）
- キチヌ
- ナンヨウチヌ
- ミナミクロダイ

フグ目

フグ科

フグ亜科

トラフグ属
- クサフグ
オキナワフグ属
- オキナワフグ

出典・脚注

[脚注の使い方]

^ “Eschmeyer's Catalog of Fishes Classification”. 2025年8月18日閲覧。
^ ヤツメウナギなどの無顎類は魚類に含めないとする意見もある。
^ 志賀健司 2010 石狩のチョウザメ　石狩ファイル No.0122-01 2010年10月31日発行 https://www.city.ishikari.hokkaido.jp/museum/pdf/if0122.pdf
^ 現時点では、国内における繁殖は確認されていない。詳しくはガー目#琵琶湖などにおける繁殖の可能性とその影響についてを参照のこと
^ 汽水域に入ることもある

参考文献

日本の淡水魚山と渓谷社

外部リンク

日本淡水魚一覧

[1] “Eschmeyer's Catalog of Fishes Classification”. 2025年8月18日閲覧。

[2] ヤツメウナギなどの無顎類は魚類に含めないとする意見もある。

[3] 志賀健司 2010 石狩のチョウザメ　石狩ファイル No.0122-01 2010年10月31日発行 https://www.city.ishikari.hokkaido.jp/museum/pdf/if0122.pdf

[4] 現時点では、国内における繁殖は確認されていない。詳しくはガー目#琵琶湖などにおける繁殖の可能性とその影響についてを参照のこと

[5] 汽水域に入ることもある

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

表話編歴日本の動物
脊椎動物	哺乳類 · 鳥類 · 爬虫類 · 両生類 · 淡水魚類
無脊椎動物	昆虫類（蝶類 · 蛾類 · 甲虫） · クモ類 · 甲殻類 · 貝類
天然記念物	哺乳類 · 鳥類 · 両生類・爬虫類 · 魚類 · 無脊椎動物
レッドリスト / レッドデータブック	哺乳類 · 鳥類 · 両生類・爬虫類 · 汽水・淡水魚類 · 昆虫類 · 貝類 · その他無脊椎動物

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