日本編
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2005年頃以降、関東地区では放送されていない。 なお、2007年5月よりYahoo!動画で公開されている（同年11月までの予定）。
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日本編
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「ジェノサイド (小説)」の記事における「日本編」の解説
古賀 研人（こが けんと） 主人公。大学院生で専門分野は創薬化学。亡き父の残したメッセージに従いGPCRの作動薬創薬に取り組む。菅井が書いた生前の誠治が唯一脚光を浴びることになった『灰色の記事』がもとで父に対して軽蔑の念を抱く。 李 正勲 韓国人留学生。日本語が堪能で創薬化学とコンピューターに通じる。研人の心強い味方。新大久保駅乗客転落事故の犠牲となった韓国人留学生がモデル。 坂井 友里 研人の周囲に現れる謎の女性。誠治の知人だというが、誠治の同僚たちはその存在を知らない。 古賀 誠治（こが せいじ） ウィルス学の大学教授で研人の父親。三鷹駅で胸部動脈瘤破裂により死亡。一人息子にやりかけの仕事を託す。 菅井 大手新聞社の科学欄担当。かつて携わった記事で誠治とは知己の関係。生前の誠治から『ハイズマン・レポート』について尋ねられ、その詳細を調べている。研人とも旧知だが、前述の確執を抱えている。 園田 研人の担当教授。50代の男性。 河合 麻里奈（かわい まりな） 研人が学部生時代に同じサークルに所属していた女子学生。研人が好意を持つ相手。 土井 明弘（どい あきひろ） 研人の友人。臨床系にいる。研人と正勲を引き合わせる。
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日本編
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「マージナル・オペレーション」の記事における「日本編」の解説
1年後、少年兵たちを伴って観光のために日本に入国したアラタ達は、成田空港で通り魔を取り押さえたことから、日本政府の安全保障セクションの担当者である女性イトウさん（仮称）に、テロリスト化しつつある武闘派の新興宗教組織の壊滅を依頼される。
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日本編
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「マージナル・オペレーション」の記事における「日本編」の解説
イトウ ユキエ 日本政府内の安全保障に関わるセクション（通称イトウさんち）に勤める日本人の女性。アラタ達に政府の下請け仕事をさせようと、極秘裏に接触した。公安かそれに類する組織だと思われるが、作中では明確にされていない。 ある時は「20代後半の美女」、またある時は「60代の壮年女性」の姿で現れており、外見はもとより立ち居振る舞いまでを含めた極めて高度な変装をして任務に当たっている。李世蘭は「彼女達(シスターズ)」と呼んでおり、彼女にはコジマと名乗っている。 名乗っている名前が本名なのか、本当はどのような人物なのか全く不明であるが、アラタにハニートラップをしかけたり、シャワー後は20代後半の姿であったこと、コミック版にて白髪のカツラをとった姿が描かれていることなどから20代後半～30代前半であると推察される。コミックで描かれたミャンマー編の会議では、「60代の壮年女性」の姿で出席している。 同じ作者の小説「猟犬の圀」にて、公安からスパイ組織に転属した須頭幸恵（すがしらゆきえ）という人物が出ており、改3巻にて須頭調査官とも呼ばれていたため、同一人物である可能性が高い。 シュワ 武闘派新興宗教の元僧侶で、初老の男性。日本政府に懐柔され堕落した教祖を破滅させるため、信者たちを使嗾してテロを起こすが、日本政府に雇われたアラタ達の活躍によって計画は中途で破綻し、痛み分けのような形に終わる。その後、事態の幕引きをするための交渉を行った際にアラタに興味を覚え、数人の部下たちと共に一行に合流した。 宗教者であるが、同時に裏社会を生きる人間としての世界観や人間観双方を併せ持った持った人物であり、アラタの相談役的な立場となる。 アラタたちがミャンマーへ向かう際タイへ残り、以降はキャンプ・ハキムへ送る子供たちの面接など、後方支援を担当するようになった。 梶田 シュワの部下。スキンヘッドとサングラスがトレードマークで、その風貌からタイの子供たちにマフィアと呼ばれる。モデルはライターのマフィア梶田。 アラタとシュワが合流した際には行動を共にしなかったが、後に再登場し、タイで入院しているソフィアの護衛をしていた。 原作外伝「マフィアの日」では主役を務め、タイで入院生活を送るソフィアを時折見舞い、護衛している姿が描かれた。 ソフィアをタイに残したままのアラタに対してはいい感情を持っていない。
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佳奈美 演 - 水沢エレナ 会社員。ベタなことが大好き 類 演 - 栗山航 塾講師。佳奈美と交際中。頼まれたら断れない。同僚がインフルエンザに罹り、授業を穴埋めするために佳奈美との台湾旅行をキャンセルした 香織 演 - 長谷部優 佳奈美の先輩。酔いつぶれた類を自宅まで送り…？ 晴海 演 - 白鳥羽純(X21) 佳奈美の妹。類の塾の生徒。 保 演 - 中丸新将 居酒屋「せごどん」経営。類の父親
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