ゲノミクス【genomics】
ゲノミクス
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2024/06/02 14:06 UTC 版)
ゲノミクス（英: genomics、ジェノミクス）とは、ゲノムと遺伝子について研究する生命科学の一分野。ゲノム学（ゲノムがく）、ゲノム科学（ゲノムかがく）とも。
- ^ a b c d Pevsner, Jonathan (2009). Bioinformatics and functional genomics (2nd ed.). Hoboken, N.J: Wiley-Blackwell. ISBN 9780470085851
- ^ Monya Baker (2012年9月14日). “Benchtop sequencers ship off” (Blog). Nature News Blog. 2012年12月22日閲覧。
- ^ Quail, M.; Smith, M. E.; Coupland, P.; Otto, T. D.; Harris, S. R.; Connor, T. R.; Bertoni, A.; Swerdlow, H. P. et al. (2012). “A tale of three next generation sequencing platforms: Comparison of Ion torrent, pacific biosciences and illumina MiSeq sequencers”. BMC Genomics 13: 341. doi:10.1186/1471-2164-13-341. PMC 3431227. PMID 22827831.
- ^ 北上 始, 太田 聡史, 斎藤 成也：「ビッグデータ時代のゲノミクス情報処理」、コロナ社、ISBN 978-4339024852（2014年10月）
- ^ Stein, L. (2001). “Genome Annotation: From Sequence to Biology”. Nature Reviews Genetics 2 (7): 493–503. doi:10.1038/35080529. PMID 11433356.
- 1 ゲノミクスとは
- 2 ゲノミクスの概要
- 3 ゲノム解析
- 4 関連項目
ゲノミクス
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2018/12/31 14:08 UTC 版)
全ゲノムシークエンシングは2005年3月にアメリカ国立ヒトゲノム研究所（英語版）によって優先して承認された。ゲノム概要配列は、UCSC Genome Browserで入手できる。
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ゲノミクス
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2020/10/17 04:17 UTC 版)
「レジオネラ・ニューモフィラ」の記事における「ゲノミクス」の解説
2004年、3つの臨床的肺炎レンサ球菌分離株の完全なゲノム配列の決定と公表は、特に肺炎レンサ球菌とレジオネラ属全般の分子生物学の理解への道を開いた。180のレジオネラ株の遺伝子含有量を研究するためにDNAアレイを使用した詳細な比較ゲノム解析により、高いゲノム可塑性と頻繁な遺伝子の水平伝播が明らかになった。L.ニューモフィラのライフサイクルに関するさらなる洞察は、その自然宿主であるアカントアメーバ・カステラーニ（Acanthamoeba castellanii）でのL.ニューモフィラの遺伝子発現プロファイルを調べることで得られました。L.ニューモフィラは二相性のライフサイクルを示し、遺伝子発現プロファイルに従って透過性および複製特性を定義する。
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ゲノミクス
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/06/30 07:58 UTC 版)
2017年に発表された家畜馬に対する大規模なY染色体ハプロタイプの系統解析によれば、ダーレーアラビアンはターク種であったと考えられている。子孫のY染色体から再建されたY染色体のSNPの比較では、バイアリータークとは1塩基、ゴドルフィンアラビアンとは2塩基しか違いが無く、3頭は近い関係にある。この3頭から更に父系を遡った始祖は、おおよそ300-450年前に生きていた1頭のターク種の牡馬であったと推定されている。 また、スタンダードブレッドのフライングチルダーズ系や米温血種のヤングマースク系は、ダーレーアラビアン系のSNPを持つ一方で、ホエールボーン系に発生しているインデルを持たない。父系に関しては、これらの馬の血統がほぼ正しいことが確かめられた。 一方、血統書上ダーレーアラビアンの父系子孫とされるサラブレッドのパーシモン系やセルフランセの支配系統であるオレンジピール系では、全頭でバイアリーターク系のY染色体ハプロタイプが検出された。その最近共通祖先であるセントサイモンは、実際にはダーレーアラビアンの父系子孫ではなく別の始祖であるバイアリータークの子孫である可能性が極めて高いことが明らかとなった。
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