日本メソヂスト教会 （にほんメソヂストきょうかい）は、日本のプロテスタント の教派 の一つで、1907年に設立されて、1941年に日本基督教団 の成立時に、教団に吸収されるまで存在した。この派は第二次世界大戦 後もほとんどが日本基督教団に残留した。
メソジスト監督教会 、カナダ・ウェスレアン・メソジスト教会（1974年にカナダ・メソジスト教会 と合同)、南メソジスト監督教会 の三つをメソジスト三派という。
メソジスト三派は、宣教と教育を一致させたキリスト教学校教育の面で多くの業績を挙げ、青山学院 、鎮西学院 、関西学院 、東洋英和学校 （後の麻布中学 ）、東洋英和女学院 、静岡英和女学院 、広島女学院 などの学校を主要都市に設立した。
このメソジスト三派の合同については早くから議論されていた。アメリカ・メソジスト監督教会日本総理から東洋英和学校の初代総理になったR・S・マクレイ が、明治21年（1888年）に日本にある教会と、カナダ系の日本メソジスト教会 の合同案を、アメリカ本国のメソジスト監督教会 (Methodist Episcopal Church) のニューヨーク総会に提出した。監督制度 の堅持を条件にマクレイの請願が承認された。監督制度を認めない、カナダ系の日本メソジスト教会はこの決定に不満であったが、合同の動きは継続していた。そこで、南メソジスト監督教会がこの合同に参加を表明したので、三派合同への動きが始まった。
三派の合同の協力関係を推進するために、明治24年（1891年）に三派合同の機関紙『護教 』が創刊された。さらに、日露戦争 で合同の機運は盛り上がり、明治39年（1906年）に三派独立と独立教会の具体的なプログラムが作成された。アメリカの母団体側でも検討が進められた。日本側の合同推進は本多庸一 を中心に進められた。
明治40年（1907年）5月22日から6月7日にかけて青山学院 講堂で合同総会が開催された。新教会の初代監督に本多庸一 が選出された。総会は代議員を決定し、常置委員を選出し、年会組織を決定し、総会は終了した。
新教会の成立後も宣教師たちは、総会や年会や部会の職についたり、以前と同じように日本人牧師と同じ活動をしていた。しかし、日本メソジスト教会の枠外で働いて別の教会を勝手に作ることは禁じられた。
明治44年（1911年）第二回総会で、伝道区が創設された。これは、伝道困難な地域を宣教師が引き受けて、ミッションの資金により開拓伝道を行う、特別区である。
中村敏 『日本における福音派の歴史』いのちのことば社、2000年高橋昌郎 『明治のキリスト教』吉川弘文館 、2003年中村敏『日本キリスト教宣教史』いのちのことば社 、2009年
守部喜雅『日本宣教の夜明け』いのちのことば社、2009年
指導者 11部制
第1部 第2部 第3部 第4部 第5部 第6部 第7部 第8部 第9部 第10部 第11部
教団非加入の単立
関連項目
キリスト教ポータル
