薬剤設計とは? わかりやすく解説

薬剤設計

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/03/02 03:37 UTC 版)

Folding@home」の記事における「薬剤設計」の解説

薬物は、標的分子上の特定の位置結合し標的無効にしたり、コンフォメーション変化起こしたりするなど、所望変化引き起こすことで機能する理想的には、薬物は非常に特異的に作用し、他の生物学的機能阻害することなく標的にのみ結合することが望ましい。 しかし、2つ分子がどこでどのように強固に結合するかを正確に決定することは困難である。 計算能力限界があるため、現在のインシリコ(in silico)法は通常正確さ速度両立させなければならない例えば、計算コストのかかる自由エネルギー計算代わりに迅速なタンパク質ドッキング英語版)を使用するなどである。 Folding@home計算性能により、研究者両方方法使用し、その効率性信頼性評価することができる。 コンピュータ支援創薬は、創薬スピードアップコスト削減につながる可能性がある。 2010年Folding@homeは、MSM自由エネルギー計算用いてX線結晶構造解析によって実験的に決定され結晶構造から、ヴィリン(英語版タンパク質ネイティブ状態1.8オングストローム(Å)の平均二乗偏差(RMSD)以内予測した。 この精度は、本質的に構造化されていないタンパク質を含む、将来タンパク質構造予測手法に意味を持つ。 科学者たちは、Folding@home利用して最後の手段の英語版)であるバンコマイシンや、ペニシリンなどの抗生物質分解するβ-ラクタマーゼ研究することで、薬剤耐性研究行ってきた。 化学活性は、タンパク質活性部位沿って発生する従来薬物設計法では、標的タンパク質1つ剛体構造存在する仮定して、この部位強固に結合し、その活性阻害する。 しかし、このアプローチ有効に働くのは、全タンパク質の約15%に過ぎないタンパク質にはアロステリックサイトが存在し、低分子結合することでタンパク質の構造変化させ、最終的にタンパク質活性影響与える。 これらの部位魅力的な創薬標的であるが、その位置特定するには非常に計算コストがかかる。 2012年には、Folding@homeMSM用いてβ-ラクタマーゼインターロイキン-2RNase H3つの医学的に関連のあるタンパク質のアロステリックサイトを同定した。 既知抗生物質約半分は、細菌リボソーム働き阻害するもので、メッセンジャーRNAタンパク質翻訳することでタンパク質生合成を行う、大きくて複雑な生化学的機械である。 マクロライド系抗生物質リボソーム出口トンネル塞ぎ細菌必須タンパク質の合成妨げる。 2007年パンデ研究室は、新し抗生物質研究設計のための助成金受けた2008年には、Folding@home使って、このトンネル内部と、特定の分子どのように影響するかを研究したリボソームの完全な構造2011年時点決定されており、Folding@homeでは、リボソームタンパク質英語版)の機能多くがほとんど解明されていないため、リボソームタンパク質シミュレーション行っている。

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薬剤設計

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/03/17 15:09 UTC 版)

ロイコトリエン拮抗薬」の記事における「薬剤設計」の解説

ロイコトリエン作用阻害する為に、主に2つ方法取られる

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