計算コストとは? わかりやすく解説

計算コスト

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/01/26 10:06 UTC 版)

水モデル」の記事における「計算コスト」の解説

シミュレーションの計算コストは、水モデルの持つ相互作用サイトの数と共に増加するCPU時間計算すべき原子間距離の数におおむね比例する。3-サイトモデルでは、水分子それぞれの対について9つの距離が必要である。4-サイトモデルでは10の距離、5-サイトモデルでは17の距離、6-サイトモデルでは26の距離が必要である。 分子動力学法において剛直な水モデル用いる時は、拘束アルゴリズム用いて構造拘束し続けるための追加コスト存在する(しかし拘束され結合長用いると、タイムステップの増加可能になることが多い)。

※この「計算コスト」の解説は、「水モデル」の解説の一部です。
「計算コスト」を含む「水モデル」の記事については、「水モデル」の概要を参照ください。

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