活性部位

生物学用語辞典

活性部位

英訳・(英)同義/類義語：active site

酵素の分子構造の中で、実際に反応に関与するアミノ酸残基が存在する場所、またはアミノ酸残基のグループ。

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活性部位

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2023/11/04 02:47 UTC 版)

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酵素反応の誘導適合モデル

分子生物学における活性部位（かっせいぶい、英: active site）は、基質が結合し化学反応が進む酵素の部位のことである。多くの酵素はタンパク質からできているが、リボザイムと呼ばれるリボ核酸でできた酵素も存在する。酵素の活性部位は、基質の認識に関わるアミノ酸（又は核酸）が並んだ溝又はポケットで見られる。触媒反応に直接関わる残基は、活性部位残基と呼ばれる。

結合機構

酵素の作用機構には、「鍵と鍵穴モデル」と「誘導適合モデル」の2つのモデルが提案されている。鍵と鍵穴モデルは、活性部位は特定の基質と完全にぴったり合うものであり、一度基質が酵素に結合するとそれ以上の修正は必要ないという最も簡便なモデルである。誘導適合モデルは、鍵と鍵穴モデルを発展させたもので、活性部位はより柔軟であり、活性部位でのある残基の存在によって正しい基質が配置され、基質が結合した後に構造変化が起こると考えるものである。

化学

基質は水素結合、疎水結合、ファンデルワールス力等によって酵素の活性部位と結合する。活性部位の残基はプロトンや基質のその他の官能基のドナーやアクセプターとして働く。言い換えると、活性部位は反応の活性化エネルギーに応じて反応機構を変える。生成物は立体障害により活性部位では不安定となるために放出され、酵素は当初の非結合状態に戻る。

関連項目

• 酵素反応
• ヒュー・テイラー

外部リンク

• Catalytic Site Atlas (CSA) — hosted by EMBL-EBI

表 話 編 歴 酵素
活性	活性部位 結合部位 触媒三残基 オキシアニオンホール（英語版） 基質多様性（英語版） 拡散律速酵素（英語版） 補酵素 補因子 酵素触媒反応
調整	アロステリック効果 協同性  (英語版)  酵素阻害剤 酵素活性化剤
分類	EC番号 酵素スーパーファミリー  (英語版)  酵素ファミリー 酵素の一覧（英語版）
動力学	酵素反応速度論 イーディー＝ホフステー図 ヘインズ＝ウルフプロット ラインウィーバー＝バークプロット ミカエリス・メンテン式
種類	EC1 酸化還元酵素 (list) EC2 転移酵素 (list) EC3 加水分解酵素 (list) EC4 リアーゼ (list) EC5 異性化酵素 (list) EC6 リガーゼ (list) EC7 トランスロカーゼ（英語版） (list)

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活性部位

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/05/04 06:25 UTC 版)

「タンパク質構造予測」の記事における「活性部位」の解説

化学的に特異的な基質と相互作用することができ、タンパク質に生物学的活性を与える、三次構造（三次元）または四次構造（タンパク質サブユニット）内のアミノ酸側鎖の局所的な組み合わせのこと。全く異なるアミノ酸配列のタンパク質は、同じ活性部位を持つ構造に折りたたまれることがある。