結合機構とは? わかりやすく解説

結合機構

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2014/02/05 05:30 UTC 版)

活性部位」の記事における「結合機構」の解説

酵素作用機構には、「鍵と鍵穴モデル」と「誘導適合モデル」の2つのモデル提案されている。鍵と鍵穴モデルは、活性部位特定の基質と完全にぴったり合うものであり、一度基質酵素結合するそれ以上修正必要ないという最も簡便なモデルである。誘導適合モデルは、鍵と鍵穴モデル発展させたもので、活性部位はより柔軟であり、活性部位でのある残基存在によって正し基質配置され基質結合した後に構造変化が起こると考えるものである

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「結合機構」を含む「活性部位」の記事については、「活性部位」の概要を参照ください。


結合機構

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/07/23 05:32 UTC 版)

セレクチン」の記事における「結合機構」の解説

セレクチンにはヒンジドメインが存在しナノ秒スケールで「開いたコンフォメーションと「閉じたコンフォメーションの間で迅速な変化を行う。ずり応力によって、セレクチン分子は「開いたコンフォメーションを好むようになる白血球ローリングにおいては、「開いたコンフォメーションセレクチンはPSGL-1鎖の上部にあるシアリルルイス分子結合しセレクチンとシアリルルイスの結合が切れるとスライドして鎖の下部の他のシアリルルイス分子新たな結合形成することができ、全体として結合親和性高めることができる。しかし、「閉じたコンフォメーションでは、セレクチン1つのシアリルルイス分子にしか結合できず、そのため結合親和性大きく低下するこのようにセレクチンはキャッチアンドスリップボンド(catch and slip bond)の挙動を示す。弱いずり応力下では、より多くセレクチンが「開いた構造を好むため、結合関わる引っ張り力の増加によって結合親和性実際に増加する。強いずり応力下では、セレクチンリガンドの結合依然として通常のスリップボンドであるため、結合親和性低下する。このずり応力閾値は、白血球血管外遊出開始するのに適した血管径の選択助けとともに鬱血時の不適切白血球凝集防止助けていると考えられている。

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