構造解析

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構造解析

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2022/05/05 01:17 UTC 版)

「ホウ素」の記事における「構造解析」の解説

11Bは3/2の核スピンを持つため、核磁気共鳴分光法によって構造解析を行うことができる。11Bは天然存在比がおよそ80 %と高いため、S/N比の大きな高感度な測定結果が得られるが、スピン数が1より大きな四極子核であるため幅広かつ複雑なスペクトルとなり分解能は低い。また、10Bは熱中性子吸収能が高いため通常はホウ素の中性子回折は行えないが、同位体分離によって11Bのみからなる分析試料を作成することで中性子回折による構造解析を行うこともできる。ホウ素化合物の分子構造解析には赤外分光法やラマン分光法が利用される。例えば赤外分光法では、B-H結合は2500 cm−1に、B-N結合は1400 cm−1にそれぞれ吸収が現れる。

構造解析

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2022/03/23 12:35 UTC 版)

「医薬品化学」の記事における「構造解析」の解説

医薬品の構造は、有効性、安定性、および入手性を予測する手段の一つとして、さまざまな方法で評価される。リピンスキーの法則は、水素結合のドナーとアクセプターの数、回転可能な結合の数、表面積、および親油性に焦点を当てている。医薬品化学者が化合物を評価または分類する他のパラメータとして、合成の複雑さ、キラリティー(鏡像異性)、平坦度、芳香環数などがある。 リード化合物の構造解析は、リガンドを実際に合成する前に、計算手法を用いて行われることが多い。これは、時間と財政的な考慮 (支出など) を含み、これらに限定されない多くの理由のために行われる。目的のリガンドが研究室で合成された後、従来の方法 (TLC、NMR、GC/MSなど) で分析が行われる。

構造解析

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2018/12/20 05:01 UTC 版)

「ルマジンタンパク質」の記事における「構造解析」の解説

X線結晶構造解析により、LumPの高次構造は明らかとなっている（下図参考）。現在までに２種類のLumPの結晶構造が明らかとなっている。その全体構造は、大きく2つのドメイン（N末端側ドメインとC末端側ドメイン）に分けることができる。このことはアミノ酸配列からも、N末端側とC末端側は配列類似性が高いことから確認できる。それぞれのドメインには、6本の逆平行βストランドで構成されるβバレルを持ち、2つのαヘリックスが存在する。このうち、リガンドが確認できるのは、N末端側ドメインのみであり、C末端側には存在しない。なぜ、N末端ドメインにしか、リガンドが結合していないのか、といった点は不明である。 これらの構造学的特徴は、アミノ酸配列上相同性の高い、リボフラビン合成酵素（以下、RS）でも確認することができる。ただし、RSではC末端側にもリガンドが結合し、また、C末端には大きく突き出たαヘリックスが一本存在する。リボフラビン合成酵素においては、このC末端側のヘリックスがつがいの役目を果たし、三量体を形成することがわかっている。N末端、C末端側にリガンド結合サイトが存在することにより、三量体中で、あるRS分子のN末端側リガンド結合ドメインが隣り合う別のRS分子のC末端側のリガンド結合ドメインと近接することで、反応を触媒し、リボフラビンを合成するモデルが立てられている。LumPでは、C末端のαヘリックスを持たず、C末端側にはリガンドが結合しないために、触媒活性も持たず、単量体で存在するのだと考えられる。 現在までに本来の発色団であるDMRL、およびアナログ分子であるリボフラビン、フラビンモノヌクレオチド (FMN) の3種での構造解析が終了しており、それぞれの構造情報から予想される結合の強さと、既報の生化学的データは矛盾しないことがわかっている。 図. Lumazine protein（DMRL複合体）の全体構造 N末端側ドメインを青、C末端側ドメインを水色で示す。リガンドはN末端側にのみ結合する。