多重配列アラインメント
英訳・(英)同義/類義語：multiple sequence alignment, sequence alignment
異なるDNA配列やアミノ酸配列を比較するための手法の一つで、多数の配列を並置し、ヌクレオチドやアミノ酸の置換や欠失・挿入を部位ごとに比較できる様にしたもの。分子系統樹作成や系統分類、進化距離の推定などを行う際の基礎となる。また、ゲノムDNAの構造解析、特にショットガン法で複数の配列断片を結合する際にも利用する。
| 実験方法装置単位など： | 固定液 基本数 塩化セシウム平衡密度勾配遠心 多重配列アラインメント 好気的培養 好気的培養装置 学名 |
多重整列
(多重配列アライメント から転送)
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2014/10/19 20:24 UTC 版)
多重整列(たじゅうせいれつ、英: multiple sequence alignment)とは、DNAの塩基配列やタンパク質のアミノ酸配列について、3つ以上の配列間で対応する部分が並ぶように整列したもの、また整列すること。通常、整列する配列群は進化的類縁性を持っていることが仮定される。多重整列の結果に基づいて分子系統樹を推定することができる。
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多重配列アライメント
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「シーケンスアラインメント」の記事における「多重配列アライメント」の解説
詳細は「多重整列」を参照 多重配列アライメント（マルチプルアラインメント、英語: multiple alignment）は3配列以上を扱うペアワイズアラインメントの拡張で、進化的に保存された配列の同定などに用いられる。多重アライメント方式は与えられたシーケンス全てに対してアライメントを試みる。多重アライメントはよく、進化に関係するという仮説のグループが交わる保存配列領域の決定に用いられる。このような保存配列のモチーフは酵素の触媒の活性サイトを位置づける構造と反応機構の情報の組み合わせに用いられる。アライメントは系統樹を組み立てることで進化の関係を立証するのを助けるのにも用いられる。多重配列アライメントはコンピュータ処理的にNP完全な組合せ最適化問題につながる問題の定式化や生成が難しい。それでもバイオインフォマティクスにおいてこれらのアライメントのユーティリティは3つ以上のアライメントに対する適切な方式の種類の開発に役立つ。
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