配列アラインメントとは? わかりやすく解説

Weblio 辞書 > 学問 > 生物学用語 > 配列アラインメントの意味・解説 

配列アラインメント

英訳・(英)同義/類義語:sequence alignment

分子生物学分子進化学ゲノム生物学の用語で、比較類似性の高い複数配列相互に比較する目的で、同じ配列を示す部分そろえたり、異な部分間隙入れたりして並べること。

多重配列アラインメント

「生物学用語辞典」の他の用語
実験方法装置単位など:  固定液  基本数  塩化セシウム平衡密度勾配遠心  多重配列アラインメント  好気的培養  好気的培養装置  学名

シーケンスアラインメント

(配列アラインメント から転送)

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2023/04/22 19:12 UTC 版)

バイオインフォマティクスにおいて、シーケンスアラインメントとは、DNARNAタンパク質配列一次構造)の類似した領域を特定できるように並べたもので、機能的、構造的、あるいは進化的な配列の関係性を知る手がかりを与える。


  1. ^ Wang L, Jiang T. (1994). “On the complexity of multiple sequence alignment”. J Comput Biol 1 (4): 337–48. doi:10.1089/cmb.1994.1.337. PMID 8790475. http://www.liebertonline.com/doi/abs/10.1089/cmb.1994.1.337. 
  2. ^ Elias, Isaac (2006). “Settling the intractability of multiple alignment”. J Comput Biol 13 (7): 1323–1339. doi:10.1089/cmb.2006.13.1323. PMID 17037961. http://www.liebertonline.com/doi/abs/10.1089/cmb.2006.13.1323. 
  3. ^ Lipman DJ, Altschul SF, Kececioglu JD (1989). “A tool for multiple sequence alignment”. Proc Natl Acad Sci USA 86 (12): 4412–5. doi:10.1073/pnas.86.12.4412. PMC 287279. PMID 2734293. http://www.pnas.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=2734293. 
  4. ^ Higgins DG, Sharp PM (1988). “CLUSTAL: a package for performing multiple sequence alignment on a microcomputer”. Gene 73 (1): 237–44. doi:10.1016/0378-1119(88)90330-7. PMID 3243435. http://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/0378-1119(88)90330-7. 
  5. ^ Thompson JD, Higgins DG, Gibson TJ. (1994). “CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice”. Nucleic Acids Res 22 (22): 4673–80. doi:10.1093/nar/22.22.4673. PMC 308517. PMID 7984417. http://nar.oxfordjournals.org/content/22/22/4673. 
  6. ^ Chenna R, Sugawara H, Koike T, Lopez R, Gibson TJ, Higgins DG, Thompson JD. (2003). “Multiple sequence alignment with the Clustal series of programs”. Nucleic Acids Res 31 (13): 3497–500. doi:10.1093/nar/gkg500. PMC 168907. PMID 12824352. http://nar.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=12824352. 
  7. ^ Notredame C, Higgins DG, Heringa J. (2000). “T-Coffee: A novel method for fast and accurate multiple sequence alignment”. J Mol Biol 302 (1): 205–17. doi:10.1006/jmbi.2000.4042. PMID 10964570. http://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0022-2836(00)94042-7. 
  8. ^ Hirosawa M, Totoki Y, Hoshida M, Ishikawa M. (1995). “Comprehensive study on iterative algorithms of multiple sequence alignment”. Comput Appl Biosci 11 (1): 13–8. doi:10.1093/bioinformatics/11.1.13. PMID 7796270. http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/11/1/13. 
  9. ^ Karplus K, Barrett C, Hughey R. (1998). “Hidden Markov models for detecting remote protein homologies”. Bioinformatics 14 (10): 846–856. doi:10.1093/bioinformatics/14.10.846. PMID 9927713. http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=9927713. 


「シーケンスアラインメント」の続きの解説一覧


英和和英テキスト翻訳>> Weblio翻訳
英語⇒日本語日本語⇒英語
  

辞書ショートカット

すべての辞書の索引

「配列アラインメント」の関連用語

配列アラインメントのお隣キーワード
検索ランキング

   

英語⇒日本語
日本語⇒英語
   



配列アラインメントのページの著作権
Weblio 辞書 情報提供元は 参加元一覧 にて確認できます。

   
JabionJabion
Copyright (C) 2024 NII,NIG,TUS. All Rights Reserved.
ウィキペディアウィキペディア
All text is available under the terms of the GNU Free Documentation License.
この記事は、ウィキペディアのシーケンスアラインメント (改訂履歴)の記事を複製、再配布したものにあたり、GNU Free Documentation Licenseというライセンスの下で提供されています。 Weblio辞書に掲載されているウィキペディアの記事も、全てGNU Free Documentation Licenseの元に提供されております。

©2024 GRAS Group, Inc.RSS