最近隣法
近隣結合法
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/10/31 16:54 UTC 版)
近隣結合法（きんりんけつごうほう、Neighbor joining method）は、系統樹を作製するためのボトムアップ式のクラスタ解析法。星型の樹形から出発してOTU（操作上分類単位、系統樹の葉にあたる分類群）をクラスタリングする各段階において、総分岐長を最小化するOTUの組を発見することを原理とする。近隣結合法では解析可能な系統樹の樹形や枝長を短時間で求めることができる。1987年に斎藤成也・根井正利が発表した[1]。
- ^ a b c Saitou N; Nei M (1987). “The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees”. Molecular Biology and Evolution 4 (4): 406-425.
- ^ a b c d e f g h i 松井求「分子系統解析の最前線」『JSBi Bioinformatics Review』第2巻第1号、2021年、 30-57頁、 doi:10.11234/jsbibr.2021.7。
- ^ a b c d 長谷川英祐. “第７章 進化と系統 -進化の歴史を再現する-”. 北海道大学大学院農学研究院・大学院農学院・農学部. 2021年10月23日閲覧。
- ^ a b c d 高松進「分子系統学の基礎」『植物防疫』第59巻第3号、2005年、 64-69頁。
- ^ a b c d 隈啓一、加藤和貴「実践的系統樹推定方法」『化学と生物』第44巻第3号、2006年、 185-191頁、 doi:10.1271/kagakutoseibutsu1962.44.185。
- ^ 三中信宏「分子系統学：最近の進歩と今後の展望」『植物防疫』第63巻第3号、2009年、 192-196頁。
- ^ 益子理絵、山田真介、山名早人「分枝系統樹構成法に関する最新技術動向」『情報処理学会第65回全国大会講演論文集』第1号、2003年、 233-234頁。
[続きの解説]
「近隣結合法」の続きの解説一覧
- 1 近隣結合法とは
- 2 近隣結合法の概要
- 3 関連項目
- 近隣結合法のページへのリンク
