DNAバーコーディング
読み方：ディーエヌエーバーコーディング
英語：DNA barcoding
生物の種ごとに異なるDNAの塩基配列を基にして、迅速に種の同定を行う技術。DNAバーコーディングでは、生物のゲノムのうち、「バーコード領域」と呼ばれる600-800塩基対程度の短い領域が用いられ、この領域の解析を、あたかもバーコードをスキャンするように短時間で行うことが目標とされている。
対象の未同定の生物にDNAバーコーディングの手法を適用する場合、まずDNAを抽出し、バーコード領域の塩基配列を決定（シーケンシング）する必要がある。この作業で得られた配列をデータベース上の配列データと照合し、適合度の高い配列を抽出することで、種の同定が可能になる。博物館に所蔵された生物標本からDNAを抽出し、DNAバーコーディングの手法を適用する試みもなされている。
DNAバーコーディングは、ゲルフ大学のポール・ヒバート教授により、2003年に提唱された。2013年現在、ヒバート教授を中心として「国際バーコードオブライフ（iBOL）」プロジェクトが進められており、2015年までに世界中から50万種、500万標本の「バーコード」を取得し、データベースに登録することが目標とされている。日本では、「日本バーコードオブライフ・イニシアチブ（JBOLI）」がDNAバーコーディングの普及に向けた活動を行っている。
種同定の作業は、生物の分類学的研究のほか、生物の保全、農林水産業、医療、食品検査など様々な分野で必要とされており、その作業に伴う負担や不正確性、専門的知識の必要性などを軽減しうるDNAバーコーディングの技術が、今後広く応用されることが期待されている。
関連サイト：
Barcode of Life
日本バーコードオブライフ・イニシアチブ
英語：DNA barcoding
生物の種ごとに異なるDNAの塩基配列を基にして、迅速に種の同定を行う技術。DNAバーコーディングでは、生物のゲノムのうち、「バーコード領域」と呼ばれる600-800塩基対程度の短い領域が用いられ、この領域の解析を、あたかもバーコードをスキャンするように短時間で行うことが目標とされている。
対象の未同定の生物にDNAバーコーディングの手法を適用する場合、まずDNAを抽出し、バーコード領域の塩基配列を決定（シーケンシング）する必要がある。この作業で得られた配列をデータベース上の配列データと照合し、適合度の高い配列を抽出することで、種の同定が可能になる。博物館に所蔵された生物標本からDNAを抽出し、DNAバーコーディングの手法を適用する試みもなされている。
DNAバーコーディングは、ゲルフ大学のポール・ヒバート教授により、2003年に提唱された。2013年現在、ヒバート教授を中心として「国際バーコードオブライフ（iBOL）」プロジェクトが進められており、2015年までに世界中から50万種、500万標本の「バーコード」を取得し、データベースに登録することが目標とされている。日本では、「日本バーコードオブライフ・イニシアチブ（JBOLI）」がDNAバーコーディングの普及に向けた活動を行っている。
種同定の作業は、生物の分類学的研究のほか、生物の保全、農林水産業、医療、食品検査など様々な分野で必要とされており、その作業に伴う負担や不正確性、専門的知識の必要性などを軽減しうるDNAバーコーディングの技術が、今後広く応用されることが期待されている。
関連サイト：
Barcode of Life
日本バーコードオブライフ・イニシアチブ
ディーエヌエー‐バーコーディング【DNAバーコーディング】
DNAバーコーディング
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2020/10/15 19:54 UTC 版)
DNAバーコーディング (DNA barcoding) は、短い遺伝子マーカーを利用してDNAの配列から種を特定する系統学的手法である[1]。分子系統学とは分類の決定に主眼が置かれるが、DNAバーコーディングは未知のサンプルの種を決定することに使われるという点で異なる。DNAバーコーディングは未知の種の同定や同一種とみなすかどうかなどに利用されるが、DNAバーコーディングだけで決定出来るというわけではない。
- ^ Hebert, Paul D. N.; Cywinska, Alina; Ball, Shelley L.; deWaard, Jeremy R. (2003-02-07). “Biological identifications through DNA barcodes”. Proceedings. Biological Sciences 270 (1512): 313–321. doi:10.1098/rspb.2002.2218. ISSN 0962-8452. PMC: PMC1691236. PMID 12614582.
- ^ Kress, W. John; Erickson, David L. (2008-02-26). “DNA barcodes: genes, genomics, and bioinformatics”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 105 (8): 2761–2762. doi:10.1073/pnas.0800476105. ISSN 1091-6490. PMC: PMC2268532. PMID 18287050.
- ^ Lahaye, Renaud; van der Bank, Michelle; Bogarin, Diego; Warner, Jorge; Pupulin, Franco; Gigot, Guillaume; Maurin, Olivier; Duthoit, Sylvie et al. (2008-02-26). “DNA barcoding the floras of biodiversity hotspots”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 105 (8): 2923–2928. doi:10.1073/pnas.0709936105. ISSN 1091-6490. PMC: PMC2268561. PMID 18258745.
- ^ Hebert, Paul D. N.; Cywinska, Alina; Ball, Shelley L.; deWaard, Jeremy R. (2003-02-07). “Biological identifications through DNA barcodes”. Proceedings. Biological Sciences 270 (1512): 313–321. doi:10.1098/rspb.2002.2218. ISSN 0962-8452. PMC: PMC1691236. PMID 12614582.
- ^ CBOL Plant Working Group (2009-08-04). “A DNA barcode for land plants”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 106 (31): 12794–12797. doi:10.1073/pnas.0905845106. ISSN 1091-6490. PMC: PMC2722355. PMID 19666622.
- ^ Ratnasingham, Sujeevan; Hebert, Paul D. N. (2007-05-01). “bold: The Barcode of Life Data System (http://www.barcodinglife.org)”. Molecular Ecology Notes 7 (3): 355–364. doi:10.1111/j.1471-8286.2007.01678.x. ISSN 1471-8278. PMC: PMC1890991. PMID 18784790.
- ^ Kress, W. John; Wurdack, Kenneth J.; Zimmer, Elizabeth A.; Weigt, Lee A.; Janzen, Daniel H. (2005-06-07). “Use of DNA barcodes to identify flowering plants”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 102 (23): 8369–8374. doi:10.1073/pnas.0503123102. ISSN 0027-8424. PMC: PMC1142120. PMID 15928076.
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- 1 DNAバーコーディングとは
- 2 DNAバーコーディングの概要
DNAバーコーディング
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2020/11/22 06:55 UTC 版)
詳細は「DNAバーコーディング」を参照 生物が持つDNAの塩基配列を利用して同定を行うのがDNAバーコーディングである。RNAの配列を利用する場合もある。微生物や隠蔽種のように形態での同定が難しい場合や、現実的に処理できないほど大量のサンプルを同定する必要がある場合などにとくに有用で、また検索者の判断を必要としない点も特徴である。 原核生物では16S rRNAのライブラリがほぼ網羅されており、16S rRNAの配列を知ることができれば、例え未培養であろうが環境中の混合サンプルであろうが同定が可能である。
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