スーパーファミリーとは? わかりやすく解説

Weblio 辞書 > 学問 > 生物学用語 > スーパーファミリーの意味・解説 

スーパー遺伝子ファミリー

同義/類義語:スーパーファミリー
英訳・(英)同義/類義語:supergene family

似通った構造機能を持つ遺伝子集合免疫グロブリンスーパーファミリーなど。

タンパク質ファミリー

(スーパーファミリー から転送)

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/06/10 09:41 UTC 版)

ナビゲーションに移動 検索に移動

タンパク質ファミリー(タンパクしつファミリー、: protein family)とは、進化上の共通祖先に由来すると推定されるタンパク質をまとめたグループである。生物を進化系統により分類するように、タンパク質を進化の観点から分類する意味がある。同様の概念で遺伝子をまとめた「遺伝子ファミリー」(遺伝子族)もあるが、これもタンパク質ファミリーにほぼ対応する(タンパク質をコードしないncRNA遺伝子を除く)。

具体的には、一次構造相同性が統計学的に有意に高いものを、共通祖先タンパク質に由来すると想定し、タンパク質ファミリーを設定している。タンパク質分子を構成する構造上の単位には、立体的および機能的単位であるドメインや、さらに小規模な構造的特徴であるモチーフがあるが、ドメインを一次構造に基づき分類したグループ(ドメインファミリー)がタンパク質ファミリーの基本となっている。類似構造を有しながら一次構造の配列類似性は非常に低いドメインあるいはタンパク質もあるが、このようなものは"収束進化"によると考えられ、一般には同じファミリーにまとめない。一般のタンパク質は複数のドメインからできており、タンパク質ファミリーはどのようなドメインファミリーからなるかによって決められる。

タンパク質をコードする遺伝子は進化の過程で遺伝子シャフリングを受け、これによって独立に進化しうる各ドメインが組み合わされてタンパク質分子を構成している。このため、1つのファミリーにまとめられるタンパク質でも、そのドメインの並び方は違う場合もある。例えば、ABC輸送体スーパーファミリーは知られている全生物種がそれぞれ多数を持つ巨大なグループであるが、構成ドメインの並び方は種類により異なり、さらにこれらが複数の分子(サブユニット)に分かれているものもある。

さらには1種類のタンパク質が部分的な特徴から複数のファミリーに分類されうることもある。例えば細胞外ドメインが免疫グロブリンスーパーファミリーに、細胞内ドメインがチロシンキナーゼファミリーに属す受容体線維芽細胞増殖因子受容体)などが知られている。

ファミリーの定義は研究者により異なり、またファミリーの範囲も厳密に定義されるものではない。ファミリーより広い範囲をスーパーファミリー、より狭い範囲をサブファミリーとする分類も用いられるが、いずれも厳密に定義されるものではなく相対的な概念である。

タンパク質ファミリーおよび遺伝子ファミリーは2つの系列に分けることができる。1つは、の分化とともに同じ祖先遺伝子が分化し、別の生物が互いに類似の遺伝子またはタンパク質を持つに至る場合で、オーソログという。これは一般に同じまたはよく類似した機能を持つ。他の1つは、遺伝子重複により、同じ種が互いに似た複数の遺伝子(タンパク質)を持つに至る場合で、パラログという。

元の1つの遺伝子が機能を保つか、あるいはその機能が不要になった場合には、パラログである他の遺伝子(または不要になった遺伝子)は機能的束縛から解放され、進化的に新しい機能を獲得することもある。一例を挙げれば、水晶体を形成しているα-クリスタリンは低分子量熱ショックタンパク質ファミリーに入れられる。つまり熱ショックタンパク質の一種が、機能的には一見異なる(ただし元来のシャペロン機能も保ち水晶体を透明化する役割を担うと考えられる)水晶体タンパク質に流用されたと考えられる。

参考文献

関連項目

外部リンク


スーパーファミリー

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/05/04 06:25 UTC 版)

タンパク質構造予測」の記事における「スーパーファミリー」の解説

遠く離れていても検出可能な配列類似性によって関連している、同じまたは異な長さタンパク質ファミリーグループこのように、あるスーパーファミリーのメンバーは、共通の進化的起源持っている。もともとはDayhoffが、スーパーファミリーであることの判断基準を、アライメントスコアに基づいて配列関連していない可能性10 6であると定義した(Dayhoff et al. 1978)。配列アライメント同一性が低いタンパク質でも、納得のゆく共通の数の構造的および機能的な特徴持っていれば、同じスーパーファミリーに分類される。スーパーファミリータンパク質は、三次元構造レベルでは共通の折りたたみなどの構造的特徴共有するが、二次構造の数や配置異な場合もある。 PIRリソースでは、同相スーパーファミリー(homeomorphic superfamily)という言葉使用して配列端から端までを揃えることができ、単一配列相同性ドメイン配列全体広がる類似性のある領域)を共有しているスーパーファミリーのことを指す。このドメインは、他のタンパク質ファミリーやスーパーファミリーと共有される、より小さな相同性ドメインから構成されている可能性もある。あるタンパク質配列には、複数のスーパーファミリーに属すドメイン含まれている可能性があり、複雑な進化の歴史示しているが、多重整列全体類似性認められれば、配列1つ同相スーパーファミリーにのみ割り当てられるまた、スーパーファミリーのアライメントには、アライメント内またアライメント両端整列しない領域含まれる場合がある。対照的に、同じファミリー配列は、アラインメント全体等してうまく整列する

※この「スーパーファミリー」の解説は、「タンパク質構造予測」の解説の一部です。
「スーパーファミリー」を含む「タンパク質構造予測」の記事については、「タンパク質構造予測」の概要を参照ください。

ウィキペディア小見出し辞書の「スーパーファミリー」の項目はプログラムで機械的に意味や本文を生成しているため、不適切な項目が含まれていることもあります。ご了承くださいませ。 お問い合わせ


英和和英テキスト翻訳>> Weblio翻訳
英語⇒日本語日本語⇒英語
  

辞書ショートカット

すべての辞書の索引

「スーパーファミリー」の関連用語

スーパーファミリーのお隣キーワード
検索ランキング

   

英語⇒日本語
日本語⇒英語
   



スーパーファミリーのページの著作権
Weblio 辞書 情報提供元は 参加元一覧 にて確認できます。

   
JabionJabion
Copyright (C) 2025 NII,NIG,TUS. All Rights Reserved.
ウィキペディアウィキペディア
All text is available under the terms of the GNU Free Documentation License.
この記事は、ウィキペディアのタンパク質ファミリー (改訂履歴)の記事を複製、再配布したものにあたり、GNU Free Documentation Licenseというライセンスの下で提供されています。 Weblio辞書に掲載されているウィキペディアの記事も、全てGNU Free Documentation Licenseの元に提供されております。
ウィキペディアウィキペディア
Text is available under GNU Free Documentation License (GFDL).
Weblio辞書に掲載されている「ウィキペディア小見出し辞書」の記事は、Wikipediaのタンパク質構造予測 (改訂履歴)、タンパク質立体構造分類データベース (改訂履歴)、上皮性ナトリウムチャネル (改訂履歴)、ホスホピルビン酸ヒドラターゼ (改訂履歴)、高移動度群タンパク質 (改訂履歴)の記事を複製、再配布したものにあたり、GNU Free Documentation Licenseというライセンスの下で提供されています。

©2025 GRAS Group, Inc.RSS