マハラノビスの平方距離とは? わかりやすく解説

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マハラノビスの平方距離


 マハラノビスの平方距離に基づき,距離の近い群に判別するということを,架空例で見てみよう
1. 2群,2変量データ
マハラノビスの平方距離
 2 群のデータ考える。各群 10 組の2 変数データとする。データ表 1通り
 第 2 群データは,第 1 群データを (100, 50) だけ平行移動したものである。
 第 1 群平均値は (59, 64),第 2 群平均値は (159, 114) である。

表 2. 変動共変動の計算
マハラノビスの平方距離
 変動共変動の計算は,表 2 のようになる第 1 群第 2 群分散・共分散行列は全く等しいことに注意
 分散・共分散行列および,その逆行列計算する

1. マハラノビスの平方距離の計算
マハラノビスの平方距離
 マハラノビスの平方距離は,分散共分散行列逆行列用いて計算する
 第 1 群10 番目の例 (111, 134) について,各群の重心までマハラノビスの平方距離の計算例を図 1 に示す。

図 2. マハラノビスの平方距離とユークリッド距離の関係
マハラノビスの平方距離
 この結果を図 2 に示す。ユークリッド距離では,緑で描いた線分は紫で描いた線分より長い(距離が長い)。しかし,第 1 群重心までのマハラノビス距離は 3.53,第 2 群重心までのマハラノビス距離は 13.03 である。その理由は,各群のデータ楕円示したような二次元正規分布)をしているので,ユークリッド距離的に楕円長軸方向短軸方向同じだ離れた点までのマハラノビス距離異なのである短軸方向の距離の方が長い)。
 それぞれのデータ各グループ属す確率は,マハラノビスの平方距離が自由度 p のカイ二乗分布に従うことに基づいて計算できる(p は判別分析用いた変数個数)。
 第 1 群10 番目の例 (111, 134) は,第 1 群までの平方距離が 3.528831972,第 2 群までの平方距離が 13.02910706 であり,p = 2 であるから,各群に属す確率それぞれ CHIDIST(3.528831972,2)=0.1712867911712320,CHIDIST(13.02910706,2)=0.0014817172941941 となる。

このデータ判別分析した結果例を以下に示す。
平均値
                      全体        第1群        第2群
                  20ケース      10ケース      10ケース
  2 Var002        109.0000      59.00000      159.0000
  3 Var003        89.00000      64.00000      114.0000

★ 判別関数

                 判別係数       標準化判別係数
  2 Var002       -0.21312         -12.43133
  3 Var003        0.11503           4.99000
    定数項       12.99238

★ 各ケース判別結果

ケース  R     P      平方距離1      平方距離2       判別1  1     1      2.75(0.253)    27.59(0.000)    12.42079
     2  1     1      0.97(0.616)    20.61(0.000)     9.81963
     3  1     1      3.07(0.216)    10.15(0.006)     3.54106
     4  1     1      2.06(0.357)    28.76(0.000)    13.35170
     5  1     1      0.01(0.993)    15.51(0.000)     7.74637
     6  1     1      1.25(0.536)     8.67(0.013)     3.71402
     7  1     1      0.12(0.940)    14.41(0.001)     7.14444
     8  1     1      2.74(0.254)    26.91(0.000)    12.08365
     9  1     1      1.50(0.473)     7.96(0.019)     3.23069
    10  1     1      3.53(0.171)    13.03(0.001)     4.75014  図 1 の計算例に示したもの
    11  2     2      9.03(0.011)     2.75(0.253)    -3.13971
    12  2     2     12.45(0.002)     0.97(0.616)    -5.74086
    13  2     2     27.11(0.000)     3.07(0.216)   -12.01944
    14  2     2      6.48(0.039)     2.06(0.357)    -2.20880
    15  2     2     15.64(0.000)     0.01(0.993)    -7.81413
    16  2     2     24.94(0.000)     1.25(0.536)   -11.84647
    17  2     2     16.96(0.000)     0.12(0.940)    -8.41605
    18  2     2      9.70(0.008)     2.74(0.254)    -3.47685
    19  2     2     26.16(0.000)     1.50(0.473)   -12.32981
    20  2     2     25.15(0.000)     3.53(0.171)   -10.81036

    注:‘平方距離'は各群の重心までのマハラノビスの平方距離
        カッコ内は各群に属す確率判別結果

              判別された群
実際の群     第1群  第2群    合計
  第1群         10       0      10
      %     (100.0) (  0.0) (100.0)
  第2群          0      10      10
      %     (  0.0) (100.0) (100.0)

                 正判別率 ・・・ 100.00%



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