在パキスタン日本国大使館 （ウルドゥー語 : پاکستان میں جاپانی سفارت خانے 英語 : Embassy of Japan in Pakistan ）は、パキスタン の首都 イスラマバード にある日本 の大使館 。在イスラマバード日本国大使館 （ウルドゥー語 : اسلام آباد میں جاپانی سفارت خانے 英語 : Embassy of Japan in Islamabad ）とも。
1952年 4月12日、来たる日本国の独立に先駆けて「在外公館の名称及び位置を定める法律」が制定され、当時の首都カラチ に在パキスタン日本国大使館 を設置することが定められる[ 1] 1952年4月28日、サンフランシスコ平和条約 の発効により日本国が独立、パキスタンも同条約締結国のうちの一国[ 2]
1959年 、パキスタンで首都の移転が決まり、それまでの首都カラチから臨時首都 ラーワルピンディー に遷都する[ 3] 1965年 5月、在パキスタン日本国大使館 付属カラチ日本人学校（英語版 ） （KJS）が設立される[ 4] 1966年 10月1日、カラチの在パキスタン日本国大使館 が臨時首都ラーワルピンディーに移転する[ 5] 1967年 10月1日、在外公館不在となっていた旧首都で最大都市のカラチに在カラチ日本国総領事館 が開設される[ 6] 1968年 4月、大使館の移転と総領事館の開設に伴い、在パキスタン日本国大使館 付属カラチ日本人学校が在カラチ日本国総領事館付属小学校に改称される[ 4] 1969年 、イスラマバード の建都が完了して、それまでの暫定首都ラーワルピンディーから新首都イスラマバードに遷都する[ 7] 1969年、ラーワルピンディーの在パキスタン日本国大使館 が首都イスラマバードに移転する[ 8]
1975年 4月、イスラマバードに日本人子女向けの補習授業校が開校される[ 9] 1987年 4月、上記の補習授業校を前身とする在パキスタン日本国大使館 附属イスラマバード日本人学校（英語版 ） （IJS）が設立される[ 9] 2002年 4月29日、イスラマバード市内のセリナ・ホテルにて在パキスタン日本国大使館 主催の「日本・パキスタン国交樹立50周年記念シンポジウム」が開催される[ 10]
在パキスタン日本大使
在カラチ在外事務所長
在カラチ全権大使
在ラワルピンディ全権大使
高木広一 1966-1967 田中弘人1967-1969
曽野明 1969 大使館移転
在イスラマバード全権大使
曽野明 1969-1972 兼松武1973-1976
根本博1976-1980
鈴木干夫1980-1982
梁井新一1982-1984
柳健一1982-1987
小林俊二1987-1990
村岡邦男1990-1994
川上隆朗 1994-1997 久保田穣1997-2000
沼田貞昭 2000-2002 渋谷實2002-2004
田中信明 2004-2006 小島誠二 2006-2008 渥美千尋 2008-2011 大江博 2011-2013 猪俣弘司 2013-2016 倉井高志（ウクライナ語版 ） 2016-2018 松田邦紀 2018-2021 和田充広 2021-2024 赤松秀一 2024-
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