MDGRAPE-3
MDGRAPE-3とは、2006年6月に日本の独立行政法人 理化学研究所（理研）、日本SGI株式会社、インテル株式会社によって共同で構築されたスーパーコンピュータシステムの名称である。
MDGRAPE-3は、理研によって開発された「MDGRAPE-3チップ」と呼ばれるLSIを24個搭載したユニット201台に、インテル社のデュアルコアプロセッサ「Xeon」を256個搭載したサーバー64台、「Xeon」を74個搭載した並列サーバー37台によって構築されている。
理論上のピーク性能としては、MDGRAPE-3は1ペタフロップス（PFLOPS）の処理速度が実現可能であるとされる。1ペタフロップスは、毎秒千兆回の演算処理を行うことができる単位である。世界のスーパーコンピュータの性能をランク付けしているTOP500ランキングにおいてMDGRAPE-3登場時（2006年6月）に第1位に位置していたIBMの「BlueGene/L」と呼ばれるシステムのピーク性能は360テラフロップス（TFLOPS）となっていた。MDGRAPE-3は理論的にIBM BlueGene/Lの3倍の性能を持っていることになる。ただ、TOP500リストの基準となるベンチマークテストの方式「Linpack」を行うことができないため、直接に比較することがはできなくなっている。
MDGRAPE-3は、分子動力学のシミュレーションのために提供され、医薬品の分析や生命現象の原子レベルでの解析が行われることになっている。
参照リンク
プレスリリース - 理化学研究所
| スーパーコンピュータ： | ベクトル型スーパーコンピュータ 京 ゴードン・ベル賞 MDGRAPE-3 Oakforest-PACS Roadrunner SX-9 |
MDGRAPE-3
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2018/06/20 15:33 UTC 版)
Jump to navigation Jump to search
|
MDGRAPE-3とは、理研の分子動力学シミュレーション専用の超高速計算機（スーパーコンピュータ）である。理研とインテル、日本SGIが共同開発した。分子動力学シミュレーションを飛躍的に加速する。
MDGRAPE-3チップは、1チップで165GFlopsの計算速度を実現する。MDGRAPE-3を用いることで、たんぱく質や新規材料等の分子動力学シミュレーションの他に、X線結晶解析での構造因子計算、渦法やSPH法による流体計算、電磁気計算、境界要素法などの計算を加速できる。
MDGRAPE-3は、IBMのRoadrunnerに先駆けて、世界で初めて毎秒1000兆回の演算(1PetaFLOPS)を達成したスパコンである。スーパーコンピューターの演算性能をはかる標準ベンチマークソフトであるLINPACKを動作させられないため、スーパーコンピューターの世界ランキングTOP500には名を連ねていないものの、理論性能では、IBMのBlue Gene/Lの3倍の演算性能を保有している[1]。
関連項目
外部リンク
- MDGRAPE-3のページへのリンク
