エムディーグレープスリーとは? わかりやすく解説

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MDGRAPE-3

読み方:エムディーグレープスリー

MDGRAPE-3とは、2006年6月日本独立行政法人 理化学研究所理研)、日本SGI株式会社インテル株式会社によって共同構築されスーパーコンピュータシステムの名称である。

MDGRAPE-3は、理研によって開発された「MDGRAPE-3チップ」と呼ばれるLSI24搭載したユニット201台に、インテル社デュアルコアプロセッサXeon」を256搭載したサーバー64台、「Xeon」を74搭載した並列サーバー37台によって構築されている。

理論上ピーク性能としては、MDGRAPE-3は1ペタフロップスPFLOPS)の処理速度実現可能であるとされる。1ペタフロップスは、毎秒千兆回の演算処理を行うことができる単位である。世界スーパーコンピュータ性能ランク付けしているTOP500ランキングにおいてMDGRAPE-3登場時(2006年6月)に第1位に位置していたIBMの「BlueGene/L」と呼ばれるシステムピーク性能360テラフロップスTFLOPSとなっていた。MDGRAPE-3は理論的にIBM BlueGene/Lの3倍の性能持っていることになる。ただ、TOP500リスト基準となるベンチマークテスト方式Linpack」を行うことができないため、直接比較することがはできなくなっている。

MDGRAPE-3は、分子動力学シミュレーションのために提供され医薬品分析生命現象原子レベルでの解析が行われることになっている


参照リンク
プレスリリース - 理化学研究所
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