癌細胞の変異解析とは? わかりやすく解説

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癌細胞の変異解析

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/06/03 05:29 UTC 版)

バイオインフォマティクス」の記事における「癌細胞の変異解析」の解説

悪性腫瘍(癌)においては癌細胞ゲノムは非常に複雑(予測不可能)な形で組み換え起きることが知られている。大規模なシーケンシング研究により、癌細胞見られるさまざまな遺伝子上の点突然変異特定進められてきた。このような研究においては膨大な量の配列データ管理するための専用自動化システム新しアルゴリズムソフトウェア作成通じてシーケンシング結果ヒトゲノム配列生殖系列多型コレクション比較するバイオインフォマティクス解析進められている。また、染色体増減比較するオリゴヌクレオチドマイクロアレイ( 比較ゲノムハイブリダイゼーション)や、既知点変異検出する一塩基多型アレイなど、新し物理的検出技術採用されています。 これらの検出方法は、ゲノム全体数十サイト同時に測定することができ、ハイスループット数千サンプル測定する場合実験ごとに数テラバイトものデータ生成する。そのため、この膨大なデータ量処理するための新しい手法に関する研究進められている。また、データにはかなりの変動性またはノイズ含まれているため、実際コピー数の変化推測するために、隠れマルコフモデルに基づく変化点分析法が開発されている。また、エクソソーム突然変異同定では、癌は遺伝子蓄積され体細胞変異疾患であり、がんには疾患発症関係する(ドライバー)変異無関係な(パッセンジャー)変異区別される2種類含まれている、という2つ重要な原則があり、生物情報学解析を行う上で重要になっている。 シーケンシング技術さらなる進歩により、癌のゲノミクス劇的に変化する可能性がある。新しい方法ソフトウェアにより、より多くの癌ゲノムをより迅速かつ手頃な価格シーケンスできるようになれば、がんによるゲノム内変異の分析とがんの種類分類がさらに発展する可能性がある。さらに、癌サンプルシーケンスからがんの進行状況追跡できるうになる可能性指摘されている。

※この「癌細胞の変異解析」の解説は、「バイオインフォマティクス」の解説の一部です。
「癌細胞の変異解析」を含む「バイオインフォマティクス」の記事については、「バイオインフォマティクス」の概要を参照ください。

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