構造的側面とは? わかりやすく解説

構造的側面

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/03/20 10:26 UTC 版)

天然変性タンパク質」の記事における「構造的側面」の解説

天然変性タンパク質細胞状況に応じてin vivo多く異な構造適合し構造またはコンフォメーションアンサンブル作り出す。 そのため、それらの構造機能強く関係している。しかし、天然状態で完全にディスオーダーしているタンパク質はわずかである。ディスオーダー大部分構造的タンパク質内の天然変性領域IDR)に見つかる。天然変性タンパク質IDP)という用語は、完全にディスオーダーしたタンパク質だけでなくIDRも含む。 タンパク質におけるディスオーダー存在とその種類は、アミノ酸配列によって決定されている。一般的にIDPは、かさ高い疎水性アミノ酸少なく極性があり電荷を持つアミノ酸が多いことで特徴づけられ、多く場合疎水性が低いと表現される。この性質との良い相互作用もたらす。さらに総電荷数の多さは、同じ電荷を持つ残基間の静電的反発のためにディスオーダー促進するこのようなディスオーダー配列十分に疎水性コア埋めて安定球状タンパク質フォールディングすることができない一部場合では、ディスオーダー配列中の疎水性クラスター共役したフォールディング結合を行う領域特定する手掛かりとなる。多くのディスオーダータンパク質には規則的な二次構造を全く持たない領域存在する。これらの領域は、構造的なループとの比較柔軟なループ呼ばれる構造的ループ強固な構造持ち1セットラマチャンドラン角しか持たないが、IDPでは複数角度が可能である。柔軟性という用語は構造有するタンパク質でも用いられるが、ディスオーダータンパク質では異な現象記述のために用いられる構造をとるタンパク質における柔軟性平衡状態と結びつけられているが、IDPではそうではない。また、多くのディスオーダータンパク質には低複雑度領域英語版)(わずかな種類残基大部分占められている配列)が存在する。低複雑度領域ディスオーダーの強い指標となるが、その逆は必ずしも正しくない。すなわち、すべてのディスオーダータンパク質が低複雑度領域有しているわけではない

※この「構造的側面」の解説は、「天然変性タンパク質」の解説の一部です。
「構造的側面」を含む「天然変性タンパク質」の記事については、「天然変性タンパク質」の概要を参照ください。

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