ハプログループF (mtDNA)とは？ わかりやすく解説

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ハプログループF (mtDNA)

出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2025/05/24 18:12 UTC 版)

ハプログループF (mtDNA)（ハプログループF (ミトコンドリアDNA)、英: Haplogroup F (mtDNA)）とは、分子人類学で用いられる、人類のミトコンドリアDNAハプログループ（型集団）の分類のうち、ハプログループNの子系統「R9」を祖先に持ち「249d」、「6392」、「10310」などの特徴的変異をもつもので、サブクレードは、F1、F2、F3、F4などである[1]。

概略

起源

この型の祖系の「R9」はNから分岐した系統にあたる。

分布

ハプログループFは、現在東南アジア最大規模の人口を持つグループである[2][3][4][5][6][7][8][9][10][11][12]。 高頻度で見られる地域は、ニコバル諸島（50%）・インドのアルナーチャル・プラデーシュ州（31%）・ジャワ（28%）・小スンダ列島（23%）・中国大陸の長江以南（特に雲南省のラフ族77%・広州26%）・ベトナム（26%）・ラオス・フィリピン（29%）・台湾原住民（27%）・日本（6.4%[13]）などである[14]。全体としてオーストロアジア系民族やオーストロネシア系民族で高頻度である。中央アジアとメラネシアでは低頻度であり、アメリカ大陸では検出されていない[15][16][17]。北アジアでもほとんど観察されないが、例外的にケット人においては23.7%の中頻度で観察される[18]。

日本での分布

日本列島では、現在、日本人の約5.34%[19]ないし約6.4%[13]がこのハプログループFに属している[20]。全国に広く分布しているが、沖縄県では比較的少ない傾向にある（平取町アイヌ 1/51 = 2.0% F1b[19]、沖縄 1/50 = 2.0% F1b[19]、沖縄 8/326 = 2.5%[21]、東海 16/282 = 5.7%[21]、宮崎県 6/100 = 6.0%[22]、北海道 14/217 = 6.5%[23]、岐阜県立病院にて受診をした人 208/2906 = 7.16%[10]、北九州 19/256 = 7.4%[21]、東京（JPT) 9/118 = 7.6%[24]、東北 28/336 = 8.3%[21]）。

日本に於けるサブクレードに関してはF1b（41/1312 = 3.13%[19]）、殊にF1b1a（3.2%[13]）が多くて、日本に於けるハプログループFの大半を占めている。その次にはF1a1b（1.0%[13]）が日本で比較的多く見られる。

日本人トップアスリートの身体能力との関連

近年、日本人のトップアスリートたちの身体能力とミトコンドリアDNAの研究が進むにつれ、瞬発系・パワー系の競技者群において、ハプログループFの頻度が高いことが指摘されている。これは、ハプログループFは、細胞内のCa2+濃度の調節や解糖系によるATP生成速度、筋収縮の速度に差があるのではないかと指摘されている[25]。

系統樹

ハプログループFのサブクレードの系統樹は、マニス・バン・オーブンとマンフレッド・カイザーの論文に基づく[26]。

  • F
    • F1 日本（東北地方等・計5.2%[13]）
      • F1+T16189C!+A14566C
      • F1a'c
        • F1a ミャンマー（チン族[28]）
          • F1a1 韓国[29]、日本[29]（東京都・愛知県[27]）、中国[29] （TMRCA 10,700 [99% CI 11,925 - 9,553]年前[29]、TMRCA 10863.5 [SD 2990.7]年前[30]）
            • F1a1a ベトナム[29]、インドネシア[29]、ウズベキスタン[29]、中国[29]（0.162%[31]）、台湾[29]、メキシコ[29]、オランダ[29]、ミャンマー（ラカイン族・チン族・ビルマ族・計0.75%[28]）
            • F1a1b 日本（1.0%[13]）、韓国[29][27]、中国（0.051%[31]）
            • F1a1c 中国[29]（0.452%[31]）、カザフスタン[29]、日本[29]（0.3%[13]）、パキスタン[29]（パンジャーブ[27]）、モンゴル[27]、ロシア（ブリヤート[27]）、タイ王国（モーケン[27]）、ミャンマー（チン族[28]）
            • F1a1d 台湾[29]（タオ族[27]、ブヌン族[27]、ツォウ族[27]、ルカイ族[27]、パイワン族[27]）、タイ王国[29]、中国[29]（0.618%[31]）、フィリピン[29]、ベトナム[27]、カンボジア[27]、マレーシア[27]、シンガポール[27]
            • F1a1e (F1a1+T8433C) 中国（江蘇省漢族1人・計0.0046%[31]）
            • F1a1f (F1a1+A10972G)
            • F1a1g (F1a1+A16497G) 中国（漢族 0.143%[31]）、ロシア（カルムイク人[27]）、日本[29]
              • F1a1g1 (F1a1g+G7976A)
              • F1a1g2 (F1a1g+T1896C) 中国（新疆ウイグル族[27]）
              • F1a1g3 (F1a1g+T4313C)
            • F1a1h (F1a1+T9141C)
            • F1a1i (F1a1+G15884A) 中国（湖南省漢族1人・四川省漢族1人・広東省漢族1人・計0.014%[31]）
              • F1a1i1 (F1a1i+G11176A) タイ王国（ヤオ族・北部タイ人[27]）、中国（貴州省ミャオ族[27]）
              • F1a1i2 (F1a1i+A1860G) 台湾[27]、中国[27]
            • F1a1j (F1a1+G94A) 中国（漢族 0.037%[31]）
              • F1a1j1 (F1a1j+A12715G) 中国（土家族[27]）
                • F1a1j1a (F1a1j1+G5147C)
                • F1a1j1b (F1a1j1+C1310T) 韓国[27]、日本（愛知県[27]）
                • F1a1j1c (F1a1j1+A9336G) 韓国[27]
                  • F1a1j1c1 (F1a1j1c+G8251A) 中国（黒竜江省ダウール族2人[27]）
                • F1a1j1d (F1a1j1+G750A)
              • F1a1j2 (F1a1j+T6071C) 中国[27]
            • F1a1k (F1a1+G8697A) 中国（江西省漢族1人・山東省漢族1人・浙江省漢族1人・江蘇省漢族1人・計0.018%[31]）
              • F1a1k1 (F1a1k+G14258A) 中国（福建省漢族1人[27]）
              • F1a1k2 (F1a1k+A5258G)
            • F1a1l (F1a1+C5435T) 韓国[27]
              • F1a1l1 (F1a1l+T6216C) ロシア（チェルカン・テレウト[27]）
            • F1a1m (F1a1+A5322C) 中国（安徽省漢族1人・計0.0046%[31]）
            • F1a1n (F1a1+A16335G) 中国（漢族 0.037%[31]）、カザフスタン[29]
            • F1a1o (F1a1+C8282A) 中国（新疆ウイグル族[27]）
            • F1a1p (F1a1+C16292T) タイ王国[29]
            • F1a1q (F1a1+C6927T)
            • F1a1r (F1a1+C14773T) 韓国[29]
          • F1a2 ベトナム[29][27]、中国[29][27]（0.180%[31]）、タイ王国[27]
            • F1a2a (F1a2+C16465T) 中国（トン族等[27]）、ベトナム（Thai族[27]）、タイ王国（Mon族[27]）
              • F1a2a1 (F1a2a+G7444A) 中国[27]
                • F1a2a1a (F1a2a1+A8659G) タイ王国（Nyaw族・プータイ族[27]）
              • F1a2a2 (F1a2a+A9053G!) 中国（湛江市漢族[27]）
            • F1a2b (F1a2+C5191T) タイ王国（クイ族・コンムアン・中部タイ人[27]）、中国（傣族・貴州省漢族[27]）
              • F1a2b1 (F1a2b+T16224C) タイ王国（Hmong族[27]）
                • F1a2b1a (F1a2b1+G7853A) タイ王国（Hmong族[27]）、ベトナム（Hmong族[27]）
                  • F1a2b1a1 (F1a2b1a+G8902C) タイ王国（Hmong族[27]）
              • F1a2b2 (F1a2b+C13599T) タイ王国（タイユアン族[27]）
          • F1a3
            • F1a3a フィリピン[29]（パラワン島バタク族・バターン州アエタ族・アバクノン語話者[27]）、台湾[27]、中国[29]（0.046%[31]）
              • F1a3a1 (F1a3a+A16129G!!+G16390A) 台湾[27]
              • F1a3a2 (F1a3a+C150T+C4011T+T16189C!) フィリピン[29]（イバタン族[27]）
              • F1a3a3 (F1a3a+C15452T) フィリピン[29]（イバタン族[27]）、台湾[27]
                • F1a3a3a (F1a3a3+G14323A) 台湾（アミ族・ブヌン族・ツォウ族等[27]）
                  • F1a3a3a1 (F1a3a3a+A5432G) 台湾（ツォウ族[27]）
              • F1a3a4 (F1a3a+T11899C) インドネシア（バンジャルマシンバンジャル族[27]）
              • F1a3a5 (F1a3a+A8985G) 台湾（プユマ族・アミ族等[27]）
              • F1a3a6 (F1a3a+T10463C) 中国[27]（河南省漢族1人・上海市漢族1人・山東省漢族1人・浙江省漢族1人・江蘇省漢族1人・計0.023%[31]）
              • F1a3a7 (F1a3a+G4113A) フィリピン[27][29]
              • F1a3a9 (F1a3a+G15148A) フィリピン[29]、マレーシア[29]、インドネシア[29]
            • F1a3+T318C 中国[27]
              • F1a3+T318C+G54C+A8718G
                • F1a3b (F1a3+T318C+G54C+A8718G+G53A+C13044T) 中国[29][27]（0.120%[31]）、台湾[27]、カザフスタン[27]
            • F1a3c (F1a3+C10223T) タイ王国（フアン族・タイダム族[27]）、中国（漢族[27]）
              • F1a3c1 (F1a3c+C868T) タイ王国（タイダム族[27]）
              • F1a3c2 (F1a3c+C3116T) タイ王国（タイユアン族[27]）
                • F1a3c2a (F1a3c2+A1037G) タイ王国（パラウン族[27]）
              • F1a3c3 (F1a3c+T8618C) タイ王国（タイユアン族・中部タイ人[27]）
            • F1a3d (F1a3+T8618C) 中国（湖北省漢族1人・計0.0046%[31]）
            • F1a3e (F1a3+C11860T) タイ王国（中部タイ人[27]）
              • F1a3e1 (F1a3e+G5252A) 中国（ウイグル族[27]）
            • F1a3f (F1a3+A15322G) 中国[27]
        • F1b
          • F1b1 ミャンマー（ナガ族[28]）
            • F1b1a 日本（3.2%[13]）、朝鮮民族、中国（0.106%[31]）、アメリカ合衆国[27]
            • F1b1b　ロシア（シベリア先住民のケット・トゥヴァ・トファ・ヤクート・エヴェン、コーカサス先住民のアディゲ、ペルミ州のロシア人等）、トルコ、カザフ、キルギス、アフガニスタン（タジク）、中国（ウイグル、ダウール、漢族[0.018%[31]]等）
            • F1b1c 中国（イ族、漢族[0.162%[31]]等）、ベトナム（ラチ族、ロロ族）、ミャンマー（ビルマ族[28]）、ネパール、パキスタン、ウズベキスタン（カラカルパク）、グルジア、ロシア（ハムニガン、ブリヤート、バシコルトスタン）
            • F1b1d 日本（0.2%[13]）、韓国
            • F1b1e ロシア（ヤクート、ブリヤート、ハムニガン、カラノガイ）、トルコ、キルギス、モンゴル、中国（ウイグル、ダウール、オロチェン、漢族[0.180%[31]]等）
            • F1b1f ロシア（エヴェンキ、ヤクート、ブリヤート）、中世のハンガリー（アヴァール）、トルコ、カザフスタン、モンゴル、中国（ウイグル、漢族[0.032%[31]]）
            • F1b1g (F1b1+C3533T+G13759A+A15398G) アゼルバイジャン
            • F1b1h (F1b1+A8774G) ロシア（ロシア人）、クロアチア、トルコ、トルクメン、キルギス、ハンガリー（中世の人骨）
        • F1c ミャンマー、韓国、中国（0.711%[31]）、日本（0.1%[13]）、パキスタン、バングラデシュ、インド、ウクライナ
              • F1c1a1 ミャンマー（ビルマ族[28]）
              • F1c1a2 ミャンマー（チン族・ラカイン族・ビルマ族・ナガ族・計5.5%[28]）
        • F1d 香港、シンガポール、ミャンマー、ネパール、台湾、中国（0.512%[31]）、北マケドニア、日本（0.2%[13]）、南アフリカ
        • F1e 中国（0.568%[31]）、日本（0.2%[13]）
          • F1e1 中国（0.078%[31]）
            • F1e1a 日本[29]（0.1%、東北地方及び中部北陸地方[13]）、中国（漢族 江西省1人・安徽省1人・上海市1人・江蘇省1人・計0.018%[31]）
            • F1e1b (F1e1+A238G) 中国（貴州省ミャオ族[27]）
          • F1e2'3
        • F1f ミャンマー、ベトナム、タイ王国、カンボジア、中国（0.323%[31]）、インドネシア
        • F1g 中国[29][27]（0.669%[31]）、ネパール[27]、タジキスタン（キルギス人[27]）、パキスタン[29]（コー人[27]）、インド（パールシー[27]）、サウジアラビア[29]、ロシア（ハカシヤ[27]）、ベトナム（キン族[27]、フラ族[27]）、タイ王国（タイ・ルー族[27]、Mon族[27]）
          • F1g1 中国（0.249%[31]）、ベトナム（ヤオ族、Hmong族）、タイ王国（Hmong族）
    • F2
    • F3 (旧名 R9a) スマトラ・中国（1.038%[31]）・ボルネオ・フィリピン・台湾など。
    • F4 中国（0.831%[31]）

ヒトのミトコンドリアDNAハプログループの系統樹

  ミトコンドリア・イブ (L)    
L0 L1 L5 L2 L6 L4 L3  
  M   N  
M7   M8   M9   D G Q N1   N2   N9   A O S X   R  
M7a C Z E I W Y R0   R9   B JT P  U
HV F J T K
H V

脚注

  1. ^ Comas, David; Plaza, Stéphanie; Wells, R. Spencer; Yuldaseva, Nadira; Lao, Oscar; Calafell, Francesc; Bertranpetit, Jaume (2004-06). “Admixture, migrations, and dispersals in Central Asia: evidence from maternal DNA lineages”. European journal of human genetics: EJHG 12 (6): 495–504. doi:10.1038/sj.ejhg.5201160. ISSN 1018-4813. PMID 14872198. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14872198. 
  2. ^ Starikovskaya, Elena B.; Sukernik, Rem I.; Derbeneva, Olga A.; Volodko, Natalia V.; Ruiz-Pesini, Eduardo; Torroni, Antonio; Brown, Michael D.; Lott, Marie T. et al. (2005-01). “Mitochondrial DNA diversity in indigenous populations of the southern extent of Siberia, and the origins of Native American haplogroups”. Annals of Human Genetics 69 (Pt 1): 67–89. doi:10.1046/j.1529-8817.2003.00127.x. ISSN 0003-4800. PMC 3905771. PMID 15638829. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15638829. 
  3. ^ Hill, Catherine; Soares, Pedro; Mormina, Maru; Macaulay, Vincent; Meehan, William; Blackburn, James; Clarke, Douglas; Raja, Joseph Maripa et al. (2006-12). “Phylogeography and ethnogenesis of aboriginal Southeast Asians”. Molecular Biology and Evolution 23 (12): 2480–2491. doi:10.1093/molbev/msl124. ISSN 0737-4038. PMID 16982817. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16982817. 
  4. ^ Hill, Catherine; Soares, Pedro; Mormina, Maru; Macaulay, Vincent; Clarke, Dougie; Blumbach, Petya B.; Vizuete-Forster, Matthieu; Forster, Peter et al. (2007-01). “A mitochondrial stratigraphy for island southeast Asia”. American Journal of Human Genetics 80 (1): 29–43. doi:10.1086/510412. ISSN 0002-9297. PMC 1876738. PMID 17160892. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17160892. 
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