ドメイン構造とは? わかりやすく解説

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ドメイン構造

英訳・(英)同義/類義語:domain structure

タンパク質で、特定の機能構造を持つことで他と区別できる領域膜貫通ドメインなど。

ドメイン

同義/類義語:ドメイン構造
英訳・(英)同義/類義語:domain, Domains, living world

一般的には特定の性質共有する領域タンパク質では、特定の機能構造を持つことで他と区別できる領域膜貫通ドメインなど。

ドメイン構造

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/06/02 06:03 UTC 版)

ビトロネクチン」の記事における「ドメイン構造」の解説

ビトロネクチンは、3つのドメインからなるN末端側のソマトメジンBドメイン(アミノ酸残基番号1-39)。このドメイン線溶系調節タンパク質であるPAI-1(Plasminogen activator inhibitor-1)に結合するドメイン形成していないが、 N末端側から45 - 47番目のアミノ酸有名な細胞接着RGD配列(Arg-Gly-Asp、アミノ酸1文字表記RGD)である。この部位細胞表面インテグリンα3に結合し細胞接着起こす。ただし、フィブロネクチンも同じRGD配列をもち、細胞表面インテグリン結合し細胞接着起こすが、インテグリン種類異なる。 分子中央(アミノ酸残基番号131-342)ドメインヘモペキシン類似の繰り返し構造がある。コラーゲントロンビンセルピンserpin、例:抗トロンビンIII複合体結合活性がある。なお、ヘモペキシンヘム化合物〉を結合しヘム代謝を担う血液タンパク質である。 C末端ドメイン(アミノ酸残基番号347-459)。この部分ヘパリン結合部位アミノ酸残基番号348 - 379)がある。この部位は、RGD配列同じくらい重要である。アミノ酸残基32個中14個が塩基性アミノ酸で、塩基性度が高くプラス帯電している。この部位ヘパリン(マイナスに帯電)と結合するヘパリン以外にも、インテグリン、オステオネクチン(osteonectin)、テネイシンなどと結合し反応性の高い部位である。

※この「ドメイン構造」の解説は、「ビトロネクチン」の解説の一部です。
「ドメイン構造」を含む「ビトロネクチン」の記事については、「ビトロネクチン」の概要を参照ください。

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