遺伝的特徴
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「ロドコッカス・ロドクラウス」の記事における「遺伝的特徴」の解説
ゲノムサイズが9.7Mbpと細菌の中で大きく、複数の小さな環状、および大きな線状プラスミドがある。線状プラスミドには異化や生分解に関与する遺伝子が多数保存されている。このため、ロドコッカス・ロドクラウスは多様な有機化合物を生分解できる。この能力ゆえに産業上利用可能な可能性が高く、盛んに研究されている。 16S rRNAの解析から、コリネバクテリウム属、ノカルディア属、マイコバクテリウム属と密接に関係する。
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遺伝的特徴
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/01/10 04:20 UTC 版)
ウラル系民族を特徴づける遺伝子はY染色体ハプログループN(厳密にはにN1a)である。このタイプは極北を中心に広く分布し、ほとんどのウラル系民族で高頻度に観察される。フィン・ウゴル系民族ではN1a1、サモエード系民族ではN1a2が高頻度である。ハプログループNは北東アジアから東アジア北部を起源とし、中国遼河文明時代人の人骨からも60%以上の高頻度で観察されている。 またmtDNAハプログループZは極北地域を中心にサーミ人、フィン人(スオミ人)、イングリア人、カレリア人、シベリア、北東アジア、中央アジア、朝鮮、日本などで観察されており、Y染色体ハプログループNと同じような流れが想定され、ウラル系民族の拡散との関連を示唆するものと考えられる。
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遺伝的特徴
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/05/10 02:42 UTC 版)
2007年現在、25のゲノムシークエンシングプロジェクトが進行中か、完了している。このプロジェクトには以下が含まれる。 Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor' Bacillus anthracis str. A1055 Bacillus anthracis str. A2012 Bacillus anthracis str. Ames Bacillus anthracis str. Australia 94 Bacillus anthracis str. CNEVA-9066 Bacillus anthracis str. Kruger B Bacillus anthracis str. Sterne Bacillus anthracis str. Vollum Bacillus anthracis str. Western North America USA6153 Bacillus cereus ATCC 10987 Bacillus cereus ATCC 14579 Bacillus cereus G9241 Bacillus cereus NVH391-98 Bacillus cereus E33L、Bacillus clausii KSM-K16 Bacillus halodurans C-125 Bacillus licheniformis ATCC 14580 Bacillus pumilus SAFR-032 Bacillus sp. NRRL B-14911 Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27 枯草菌(B. subtilis)のゲノムのシークエンシングは1997年に完了し、生きた単一の真性細菌の配列として初めて公開された。このゲノムは4.2メガ塩基対であり、タンパク質をコードする領域が4100個ある。コードするペプチドの中には、抗真菌活性を持つものも含み、それゆえにB. subtilisは生物的防除に用いられている。 炭疽菌(B. anthracis)のゲノムは5227293塩基対であり、タンパク質をコードする(予測含む)領域を5508個含む。B. anthracisのゲノムにおいて、セレウス菌及びバチルス·チューリンゲンシス――両種とも配列決定が完了している――の両ゲノムとの配列類似性が高い。B. anthracisが持つタンパク質で、B. cereusが持たないタンパク質は141個しかない。B. anthracisにおける、炭疽病に関連する病原因子のほとんど全ては2つのプラスミドにコードされており、B. cereusとのホモログである。このことから、炭疽病の原因遺伝子はB. anthracisに特異的ではなく、むしろB. cereusグループ(B. anthracis、B. cereus、B. thuringiensis)に共通であることが示唆される。炭疽菌はまた、枯草菌で見られる炭水化物代謝活性を持っているようだが、キチンとキトサンの細胞外切断酵素をコードする遺伝子を持つ;この遺伝子は昆虫病原体B. thuringiensisと非常に高い相同性をもつことが確認されている。
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遺伝的特徴
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2020/01/04 08:16 UTC 版)
「エンテロバクター・クロアカ」の記事における「遺伝的特徴」の解説
エンテロバクター・クロアカのタイプ種はATCC 49162とATCC 13047である。後者の株は亜種cloacaeのタイプ種でもあり、最初にエンテロバクター・クロアカとして完全なゲノム配列の解読がなされた株でもある。このゲノム配列には単一の環状染色体(5,314,588 bp、GenBank登録番号:CP001918)と二つの環状プラスミドpECL_A(200,370 bp、CP001919)とpECL_B(85,650 bp、CP001920)がある。このほか、エンテロバクター・クロアカのゲノム配列としてGenBank登録番号CP002272、CP002886、FP929040およびAGSY00000000が報告されている。また、cloacae亜種PR-4株の完全なゲノム配列と同亜種08XA1株のドラフト配列(それぞれGenBank登録番号:KP261383、AMGJ00000000)も明らかになっている。 その他、有益で学術的に興味深い菌株を下記に示す。 SG208株はベンゼンの生分解能を持つ。 CYS-25株は好気条件でクロム酸に強い耐性を持つ。 M59株は、アデニル酸シクラーゼ遺伝子cyaA突然変異株であり、キュウリの根への定着能力が有意に低い。
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遺伝的特徴
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/05/17 13:18 UTC 版)
近年の研究によると、北欧や中欧の民族(特にゲルマン人を祖先とする民族)ではミトコンドリアDNAとY染色体多型の顕著な親和性がみられる。これは数千年にわたって、ノルウェーを近隣民族が往来した証拠である。 ノルウェー人のY染色体ハプログループは、北欧特有のI1型が最も多い。次いで東欧やインドでみられるR1aが17.9%-30.8%、R1bが25.9%-30.8%ほど。 またノルウェーではゲール人やブリトン人特有のハプログループR1bのサブクレードであるR-L21がかなりの割合で見られる。これはヴァイキングがブリテン島を侵攻した際に現地のケルト系の住民を奴隷としてスカンディナビアに連れて帰ったことが理由として考えられる。
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