U2 snRNA認識エレメントとは? わかりやすく解説

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U2 snRNA認識エレメント

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/02/20 01:04 UTC 版)

U2 snRNA」の記事における「U2 snRNA認識エレメント」の解説

出芽酵母Saccharomyces cerevisiaeでは、U2 snRNA18個のポリペプチド結合しており、そのうち7つ全てのSmクラスsnRNPに共通の構造タンパク質である。これらの非特異的構造タンパク質は、RNA内に位置するSm結合部位呼ばれる高度に保存され認識配列(AUnG、n=4–6) を介してSmクラスsnRNA結合する。他の2つタンパク質A'とB''はU2特異的であり、snRNP組み立てのためにU2 snRNA特有の構造エレメント具体的に3'側2つステムループ)を必要とする。3つのサブユニットからなるSF3a複合体6つサブユニットからなるSF3b複合体U2 snRNA結合するU2 snRNAは、一次転写産物3'スプライス部位1840ヌクレオチド上流位置する分枝配列branch point sequenceBPS)として知られる7–12ヌクレオチド配列を介してイントロン認識関与している。酵母では、BPSコンセンサス配列長さは7ヌクレオチドであり、U2 snRNA側の相補的認識配列は6ヌクレオチドである。これら2つ配列二重らせん形成することで、保存されBPSの5位のアデノシン残基バルジ形成するバルジ形成したアデノシン残基はC3'-endo型の立体配座をとり、スプライシング因子Cwc25、Yju2(英語版)、Isy1の助けのもと、5'スプライス部位リン原子への求核攻撃in-line攻撃)のために2'-OH整列させる。求核攻撃2段階のエステル交換反応の1段階目を開始し一般的でない2'-5'-3'連結型ラリアット中間体としてイントロン切り出す2段階目のエステル交換反応2つ隣接するエクソンライゲーションを伴うものである

※この「U2 snRNA認識エレメント」の解説は、「U2 snRNA」の解説の一部です。
「U2 snRNA認識エレメント」を含む「U2 snRNA」の記事については、「U2 snRNA」の概要を参照ください。

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