核内低分子RNA
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核内低分子RNA (かくないていぶんしRNA、英: Small nuclear ribonucleic acid、略称: snRNA) は、真核細胞の細胞核の核スペックル(スプライシングスペックル)やカハール体などに見つかる低分子RNAのクラスである。snRNAの平均的な長さは約150ヌクレオチドであり、RNAポリメラーゼIIまたはRNAポリメラーゼIIIによって転写される[1]。主要な機能は、核内のmRNA前駆体 (hnRNA) のプロセシングである。また、転写因子の調節 (7SK RNA)、RNAポリメラーゼIIの調節 (B2 RNA)、テロメアの維持を助けることが示されている。
- ^ Henry, R.; Mittal, V.; Ma, B.; Kobayashi, R.; Hernanadex, N. (1 September 1998). “SNAP 19 mediates the assembly of a functional core promoter complex (SNAPc) shared by RNA polymerases II and III”. Genes & Development 12 (17): 2664–2672url=http://genesdev.cshlp.org/content/12/17/2664.full.+doi:10.1101/gad.12.17.2664. PMC: 317148. PMID 317148 .
- ^ Hadjiolov, A.A.; Venkov, P.V.; Tsanev, R.G. (November 1966). “Ribonucleic acids fractionation by density-gradient centrifugation and by agar gel electrophoresis: A comparison”. Analytical Biochemistry 17 (2): 263–267. doi:10.1016/0003-2697(66)90204-1 2014年12月12日閲覧。.
- ^ Matera, A. Gregory; Terns, Rebecca M.; Terns, Michael P. (March 2007). “Non-coding RNAs: lessons from the small nuclear and small nucleolar RNAs”. Nature Reviews Molecular Cell Biology 8 (3): 209–220. doi:10.1038/nrm2124. PMID 17318225 2014年12月12日閲覧。.
- ^ Hamm, Jörg; Darzynkiewicz, Edward; Tahara, Stanley M.; Mattaj, Iain W. (August 1990). “The trimethylguanosine cap structure of U1 snRNA is a component of a bipartite nuclear targeting signal”. Cell 62 (3): 569–577. doi:10.1016/0092-8674(90)90021-6 2014年12月12日閲覧。.
- ^ Sattler, Michael; Selenko, Philipp; Sprangers, Remco; Stier, Gunter; Bühler, Dirk; Fischer, Utz (1 January 2001). “SMN Tudor domain structure and its interaction with the Sm proteins”. Nature Structural Biology 8 (1): 27–31. doi:10.1038/83014. PMID 11135666 2014年12月12日閲覧。.
- ^ Singh, R; Reddy, R (November 1989). “Gamma-monomethyl phosphate: a cap structure in spliceosomal U6 small nuclear RNA.”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 86 (21): 8280–3. doi:10.1073/pnas.86.21.8280. PMC: 298264. PMID 2813391 2014年12月12日閲覧。.
- ^ Kiss, Tamás (1 December 2004). “Biogenesis of small nuclear RNPs”. Journal of Cell Science 117 (25): 5949–5951. doi:10.1242/jcs.01487. PMID 15564372 2014年12月12日閲覧。.
- ^ Will, Cindy L.; Lührmann, Reinhard (2011-07-01). “Spliceosome structure and function”. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology 3 (7): a003707. doi:10.1101/cshperspect.a003707. ISSN 1943-0264. PMC: 3119917. PMID 21441581 .
- ^ Legrain, P; Seraphin, B; Rosbash, M (September 1988). “Early Commitment of Yeast Pre-mRNA to the Spliceosome Pathway”. Molecular and Cellular Biology 8 (9): 3755–3760. doi:10.1128/MCB.8.9.3755. PMC: 365433. PMID 3065622 .
- ^ Burge, Christopher B; Tuschl, Thomas; Sharp, Phillip A (1999). “Splicing of Precursors to mRNAs by the Spliceosomes”. The RNA World. CSH Monographs. 37 (2nd ed.). pp. 525–560. doi:10.1101/087969589.37.525 2017年4月13日閲覧。
- ^ Fica, Sebastian M.; Mefford, Melissa A.; Piccirilli, Joseph A.; Staley, Jonathan P. (May 2014). “Evidence for a group II intron-like catalytic triplex in the spliceosome”. Nature Structural & Molecular Biology 21 (5): 464–471. doi:10.1038/nsmb.2815. ISSN 1545-9985. PMC: 4257784. PMID 24747940 .
- ^ Fica, Sebastian M.; Tuttle, Nicole; Novak, Thaddeus; Li, Nan-Sheng; Lu, Jun; Koodathingal, Prakash; Dai, Qing; Staley, Jonathan P. et al. (2013-11-14). “RNA catalyses nuclear pre-mRNA splicing”. Nature 503 (7475): 229–234. doi:10.1038/nature12734. ISSN 1476-4687. PMC: 4666680. PMID 24196718 .
- ^ Steitz, T. A.; Steitz, J. A. (1993-07-15). “A general two-metal-ion mechanism for catalytic RNA”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 90 (14): 6498–6502. doi:10.1073/pnas.90.14.6498. ISSN 0027-8424. PMC: 46959. PMID 8341661 .
- ^ Baserga, Susan J; Steitz, Joan A (1993). “The Diverse World of Small Ribonucleoproteins”. The RNA World. CSH Monographs. 24. pp. 359–381. doi:10.1101/087969380.24.359 2017年4月13日閲覧。
- ^ Kaida, Daisuke; Berg, Michael G.; Younis, Ihab; Kasim, Mumtaz; Singh, Larry N.; Wan, Lili; Dreyfuss, Gideon (29 September 2010). “U1 snRNP protects pre-mRNAs from premature cleavage and polyadenylation”. Nature 468 (7324): 664–668. doi:10.1038/nature09479. PMC: 2996489. PMID 20881964 2014年12月12日閲覧。.
- ^ Matera, A Gregory; Shpargel, Karl B (June 2006). “Pumping RNA: nuclear bodybuilding along the RNP pipeline”. Current Opinion in Cell Biology 18 (3): 317–324. doi:10.1016/j.ceb.2006.03.005. PMID 16632338 2014年12月12日閲覧。.
- ^ Wattendorf, D. J.; Muenke, M. (2005). “Prader–Willi syndrome”. Am. Fam. Physician 72: 827–830.
- ^ (Cooke DW, Divall SA, Radovick S. Normal and aberrant growth. In: Melmed S, ed. Williams Textbook of Endocrinology. 12th ed. Philadelphia, Pa: Saunders Elsevier; 2011:chap 24.)
- ^ Adachi, H; Yu, Y-T (2014). “Insight into the mechanisms and functions of spliceosomal snRNA pseudouridylation”. World Journal of Biological Chemistry 5 (4): 398–408. doi:10.4331/wjbc.v5.i4.398. PMC: 4243145. PMID 25426264 .
- ^ Kargapolova, Y.; Levin, M.; Lackner, K.; Danckwardt, S. (2017). “sCLIP — an integrated platform to study RNA–protein interactomes in biomedical research: identification of CSTF2tau in alternative processing of small nuclear RNAs”. Nucleic Acids Res. 45 (10): 6074–6086. doi:10.1093/nar/gkx152. PMC: 5449641. PMID 28334977 .
- 1 核内低分子RNAとは
- 2 核内低分子RNAの概要
- 3 U1 snRNA
- 4 関連項目
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