satellite DNAとは? わかりやすく解説

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サテライトDNA

英訳・(英)同義/類義語:satellite DNA

元々は、密度勾配遠心法ゲノムDNA大部分とはべつに密度異なDNA断片集合体として同定されDNA大部分セントロメア領域反復配列由来するため、逆にこれの存在からセントロメア領域推定使われる

サテライトDNA

(satellite DNA から転送)

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2024/01/17 08:57 UTC 版)

サテライトDNA (Satellite DNA) は、巨大なタンデムリピートの繰り返しから構成される、ノンコーディングDNAである。

セントロメアの機能の重要な役割を担っており、構造的にはヘテロクロマチンの主要な構成要素である[1][2]

「サテライトDNA」という名称は、密度勾配遠心を行った際にゲノムDNAのバンドとは別に小さなバンドを生じることにちなむ。これはサテライトDNAが短い塩基配列の繰り返しであるため、アデニン、シトシン、グアニン、チミンの各塩基の構成比がゲノム配列のそれと異なっており、これが密度の違いを生じて2本目、またはその他の小さなバンド(サテライト)を生じることによる[3]

サテライトDNAの種類

サテライトDNAは、ミニサテライト英語版マイクロサテライトと共に反復配列(タンデムリピート)と呼ばれる[4]

ヒトゲノム中には以下のようなサテライトDNAが存在する。

種類 繰り返し単位配列長 (bp) 染色体中の場所
α (alphoid DNA) 170 [5] 全染色体
β 68 セントロメア 1, 9, 13, 14, 15, 21, 22 and Y
サテライト1 25-48 ほとんどの染色体のセントロメアとヘテロクロマチン内
サテライト2 5 ほとんどの染色体
サテライト3 5 ほとんどの染色体

出典

  1. ^ Knight, Julian C. (2009). Human Genetic Diversity: Functional Consequences for Health and Disease. Oxford University Press. p. 167. ISBN 978-0-19-922769-3. https://books.google.com/books?id=NSLeurRJWsIC&pg=PA167 
  2. ^ "satellite DNA" - ドーランド医学辞典
  3. ^ Kit, S. (1961). “Equilibrium sedimentation in density gradients of DNA preparations from animal tissues”. J. Mol. Biol. 3 (6): 711–716. doi:10.1016/S0022-2836(61)80075-2. ISSN 0022-2836. PMID 14456492. 
  4. ^ Tandem Repeat - MeSHアメリカ国立医学図書館・生命科学用語シソーラス(英語)
  5. ^ Tyler-Smith, Chris; Brown, William R. A. (1987). “Structure of the major block of alphoid satellite DNA on the human Y chromosome”. Journal of Molecular Biology 195 (3): 457–470. doi:10.1016/0022-2836(87)90175-6. PMID 2821279. 

参考文献

関連項目

外部リンク


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