対応コードとは? わかりやすく解説

対応コード

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/12/11 05:40 UTC 版)

フラグメント分子軌道法」の記事における「対応コード」の解説

FMO法は、GAMESS (US)、ABINIT-MP、PAICSADBS(Advance/BioStation) といったソフトウェア利用可能である。 初期段階には、GAMESS入力はFMOutilというソフトを用いて作成された。 後に、FMOutilの大部分fuよばれる新しGUI統合された。 FuFMOGAMESS限らず、より一般的な用途利用可能BSDライセンスソフトウェアである。 大部分Pythonにより記述されており、一部クリティカル箇所Fortran記述されている。 他のGUIソフトウェアとしてはFacioが挙げられる。 FacioはFMO法に特化しており、分子クラスタタンパク質ヌクレオチド、糖やそれらの複合系(例:陽溶媒中のDNAタンパク質複合体) を自動数分以内フラグメント化することができる。また、固体界面手動フラグメント化する必要があるが、分割すべき結合クリックするだけで可能となる。更に、フラグメント間の相互作用など、FMO計算結果可視化することができる。 GAMESS (US)におけるFMO法の実装SCF種類RHFROHFUHFGVBMCSCF(英語版HF EGH EGH EGH - EG MP2 EG EG E - - CC E E - - - CI E - - - - DFT EGH - EGH - - TDDFT EG - E - - DFTB EGH - - - - E - エネルギー, G - エネルギー勾配, H - ヘッシアン (太字PCM利用可能)

※この「対応コード」の解説は、「フラグメント分子軌道法」の解説の一部です。
「対応コード」を含む「フラグメント分子軌道法」の記事については、「フラグメント分子軌道法」の概要を参照ください。

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