変性ゲルとは? わかりやすく解説

変性ゲル

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/06/21 06:12 UTC 版)

ゲル電気泳動」の記事における「変性ゲル」の解説

変性ゲル(denaturing gels)は、分析対象物の天然構造破壊して線型鎖に展開する条件下で実行する。したがって、各高分子移動度は、その鎖長と質量電荷比にのみ依存するこのように生体分子構造英語版)の二次三次四次構造破壊され一次構造のみが分析対象となる。 核酸尿素を含む緩衝液変性させることが多くタンパク質SDS-PAGEプロセス一環としてドデシル硫酸ナトリウムSDS)を使用して変性させることが多い。また、タンパク質を完全に変性させるためには、タンパク質三次構造四次構造安定化させる共有ジスルフィド結合還元する必要もあり、この方法を還元PAGEという。還元条件通常、β-メルカプトエタノールジチオトレイトール添加によって維持されるタンパク質サンプルでは、還元PAGEが最も一般的なタンパク質電気泳動英語版)の形式である。 RNA分子量適切に推定するためには変性条件が必要である。RNADNAよりも多く分子内相作用形成でき、その結果電気泳動移動度変化することがあるRNA構造破壊する変性剤として、尿素DMSOグリオキサールがもっともよく使用される。もともとRNA電気泳動変性には毒性の強い水酸化メチル水銀がよく使われており、サンプルによってはこの方法が選択されることもある。 変性ゲル電気泳動は、DNAおよびRNAのバンドパターンに基づく方法である温度勾配ゲル電気泳動法(TGGE)や変性剤濃度勾配ゲル電気泳動法DGGE)で使用される

※この「変性ゲル」の解説は、「ゲル電気泳動」の解説の一部です。
「変性ゲル」を含む「ゲル電気泳動」の記事については、「ゲル電気泳動」の概要を参照ください。

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