ビオチンへの高い親和性の起源とは? わかりやすく解説

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ビオチンへの高い親和性の起源

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/09/15 15:10 UTC 版)

ストレプトアビジン」の記事における「ビオチンへの高い親和性の起源」の解説

多数ストレプトアビジン-ビオチン複合体結晶構造は、並外れた親和性起源解明役立ってきた。第一に結合部位ビオチンとの間には高い形状相補性存在する第二に、ビオチン結合部位中に存在する時には大規模な水素結合ネットワーク存在する結合部位中の残基から直接的に作られる水素結合が8本(いわゆる水素結合の「第一殻」)存在する(Asn23、Tyr43、Ser27、Ser45、Asn49、Ser88、Thr90、Asp128が関与)。また、第一残基相互作用する残基関与する水素結合の「第二殻」も存在する。しかし、ストレプトアビジンビオチン親和性水素結合相互作用だけから予測されるものを超えており、高い親和性寄与する別の機構存在示唆されている。ビオチン結合ポケット疎水性であり、このポケット中にビオチン存在する時には数多くファンデルワールス力介した接触疎水性相互作用存在する。これが高い親和性主な原因であるとも考えられている。具体的には、ポケットには保存されたトリプトファン残基並んでいる。最後にβストランド3と4を繋ぐ柔軟なループ(L3/4)の安定化ビオチン結合付随して起こる。このループ結合したビオチン覆って閉じ結合ポケットのように働き極めて遅いビオチン解離速度一因となる。 ストレプトアビジン変異入れるとほとんどの場合ビオチン対す結合親和性低下する。これはこのような高度に最適化された形では予期されることである。しかしながら、traptavidinと命名されストレプトアビジン改変変異体は、より高い熱安定性力学的安定性加えてビオチン解離速度10倍以上遅いことが明らかにされた。この解離速度低下付随して会合速度の2倍の低下起こった

※この「ビオチンへの高い親和性の起源」の解説は、「ストレプトアビジン」の解説の一部です。
「ビオチンへの高い親和性の起源」を含む「ストレプトアビジン」の記事については、「ストレプトアビジン」の概要を参照ください。

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