状態密度の計算とは? わかりやすく解説

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状態密度の計算

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2018/12/09 20:03 UTC 版)

状態密度」の記事における「状態密度の計算」の解説

化合物生体分子高分子など、興味対象となる系は一般的に複雑である。これらの系は解析的状態密度計算するには複雑すぎ、ほとんどの場合それは不可能である。高精度状態密度コンピュータシミュレーションにより計算するアルゴリズムいくつか知られている。その一つとしてワン・ランダウのアルゴリズム挙げられるワン・ランダウ法枠組みの中では、状態密度に関する事前知識一切必要がない。まず系のコスト関数(たとえばエネルギー)を離散化し、階級 i に到達するごとに状態密度ヒストグラム g(i) を次のように更新する。 g ( i ) → g ( i ) + f {\displaystyle g(i)\rightarrow g(i)+f} ここで f は修正因子である。この階級特定の回数 (7001100000000000000♠1015) だけ到達するごとに修正因子何らかの基準により減少させる例えば以下のように処理するf n + 1 → ( 1 / 2 ) f n {\displaystyle f_{n+1}\rightarrow (1/2)f_{n}} ここで n は更新が n 回目であることを示す。特定の閾値修正因子到達したとき、たとえば fn < 10−8 となったときにシミュレーション終了するワン・ランダウ法マルチカノニカル法レプリカ交換法などに比べていくつかの利点持っている。たとえば、状態密度シミュレーション主目的として算出されるまた、ワン・ランダウ法は完全に温度依存である。この性質により、タンパク質のような非常にでこぼこしたエネルギー地形を持つ系に対して状態密度計算することができる。 数学的には、状態密度被覆写像用いて形式化することができる。

※この「状態密度の計算」の解説は、「状態密度」の解説の一部です。
「状態密度の計算」を含む「状態密度」の記事については、「状態密度」の概要を参照ください。

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