形成と安定性とは? わかりやすく解説

形成と安定性

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2020/05/06 08:43 UTC 版)

ステムループ」の記事における「形成と安定性」の解説

ステムループ構造形成は、ヘリックス(らせん、ステム領域ループ領域安定性依存している。ステムループ形成されるための第一必要条件は、折り畳まれ対合した二重らせん形成しうる相補的配列存在である。このヘリックス部分安定性は、ヘリックス長さ含まれるミスマッチまたはバルジ対合相手のない塩基)の数、対合した領域塩基組成によって決定されるミスマッチまたはバルジは、特に長いヘリックス場合少数であれば許容される塩基組成に関しては、グアニン-シトシン塩基対3つの水素結合形成するため、2つしか形成されないアデニン-ウラシル塩基対よりも安定である。RNAアデニン-ウラシル塩基対形成される水素結合は、DNAアデニン-チミン間の結合等価である。塩基芳香環π結合特定の配向整列させるスタッキング相互作用も、ヘリックス形成促進するまた、ループ領域安定性ステムループ構造形成影響与える。3塩基よりも短い「ループ」は立体障害のため不可能であり、形成されない二次構造持たない長いループも不安定である。熱力学的に最も安定ループ長さは4から5塩基である。テトラループ(英語版)として知られるUUCGの配列からなるループはよく見られ、この配列ループ構成するヌクレオチド間のスタッキング相互作用のため特に安定である。

※この「形成と安定性」の解説は、「ステムループ」の解説の一部です。
「形成と安定性」を含む「ステムループ」の記事については、「ステムループ」の概要を参照ください。

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