プロファイル【profile】
プロフィール
(プロファイル から転送)
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2024/04/16 15:23 UTC 版)
プロフィール、プロフィル、プロファイル（英語: Profile）
- 意味
- 固有名詞
- タイトル
- コンピュータ関連
- プロフィール (カラーモニター) - ソニーが発売した商品、及びシリーズ名
- Profile（プロファイル） - 吉沢亮の写真集
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プロファイル（英語版）（配列の文脈）
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/05/04 06:25 UTC 版)
「タンパク質構造予測」の記事における「プロファイル（英語版）（配列の文脈）」の解説
タンパク質ファミリーの多重整列を表すスコアリングマトリックス。プロファイルは、通常、多重整列の中で「よく保存された領域」から取得される。プロファイルはマトリックスの形式で、各列はアライメント内の位置を表し、各行はアミノ酸の1つを表す。マトリックスの値は、各アミノ酸がアライメントの対応する位置にある可能性を示す。プロファイルはターゲット配列に沿って移動され、動的計画法アルゴリズムによって最良のスコアリング領域を見つだす。マッチング時のギャップは許容されており、このケースにはアミノ酸がマッチしなかった場合の負のスコアであるギャップペナルティが含まれる。配列プロファイルは、隠れマルコフモデルで表すこともでき、プロファイルHMMと呼ばれる。
※この「プロファイル（英語版）（配列の文脈）」の解説は、「タンパク質構造予測」の解説の一部です。
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