現在のコンピュータプログラム
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/07/20 22:09 UTC 版)
「リボンダイアグラム」の記事における「現在のコンピュータプログラム」の解説
リボンダイアグラムの描画に使用される人気のあるプログラムの1つにMolscriptがある。Molscriptは、エルミートスプラインを利用して、コイル、ターン、ストランド、およびヘリックスの座標を作成する。その曲線は、方向ベクトルによって導かれるすべての制御点(Cα原子)を通過する。このプログラムは、Arthur M. Lesk、Karl Hardman、John Priestleによって伝統的な分子グラフィックスをベースに構築された。Jmolは、ウェブ上で分子構造を閲覧するためのオープンソースのJavaベースのビューアで、リボンを簡略化した「漫画」バージョンも含まれている。他にも、DeepView(例:ウレアーゼ)やMolMol(例:SH2ドメイン)などのグラフィックプログラムでもリボンダイアグラムを作成する。KiNGは、Mageの後継となるJavaベースのソフトウェアである(例:α溶血素の上面図と側面図)。 UCSF Chimera(英語版)は、リボンなどの可視化(英語版)も含む強力な分子モデリングプログラムで、特に低温電子顕微鏡データの輪郭形状と組み合わせる機能が特徴である。Warren DeLanoによるPyMOLは、人気の高い柔軟な分子グラフィックスプログラムで(Pythonベース)、対話的モードで動作し、リボンダイアグラムやその他の多くのプレゼンテーション品質の2D画像を作成する。
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