リード長
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/07/23 14:46 UTC 版)
生成されるリードの長さはシーケンシング技術によって異なる。長さ20〜40塩基対のリードは、超短鎖（ultra-short）と呼ばれる 。一般的なシーケンサーは、100〜500塩基対の範囲の長さのリードを生成する 。ただし、 Pacific Biosciencesの装置は約1500塩基対の長さのリードを生成する（2012年現在） 。リード長は生物学研究の結果に影響を与える可能性のある要因である 。たとえば、リード長が長いほど、 デノボ（de novo）ゲノムアセンブリの解像度や構造変異の検出が改善する。ヒトゲノムを定型的にデノボアセンブリするためには、10万塩基対を超えるリード長が必要になると推定されている 。シーケンシングデータを分析するためのバイオインフォマティクスのパイプラインは、通常、リード長を考慮している 。
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