ヘアピンループとは? わかりやすく解説

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ステムループ

(ヘアピンループ から転送)

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2020/05/06 08:43 UTC 版)

ステムループ: stem-loop)は、1本鎖の核酸分子内に形成される塩基対のパターンである。DNARNAのいずれでも形成されるが、RNAの方がより一般的である。ステムループ構造は、ヘアピン(hairpin)またはヘアピンループ(hairpin loop)としても知られている。ステムループは、同じ鎖の2つの領域、通常は相補的英語版ヌクレオチド配列を持つ領域が塩基対形成によって二重らせん(ステム)を形成したものであり、ステムの末端には対合していないループ領域が存在する。ステムループ構造は、多くのRNA構造において重要なビルディングブロックとなる二次構造であり、RNAのフォールディングの指示や、mRNAの構造的安定性の確保を行い、RNA結合タンパク質の認識部位や、酵素反応の基質となる[1]


  1. ^ Svoboda, P.; Di Cara, A. (2006-04). “Hairpin RNA: a secondary structure of primary importance”. Cellular and molecular life sciences: CMLS 63 (7-8): 901–908. doi:10.1007/s00018-005-5558-5. ISSN 1420-682X. PMID 16568238. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16568238. 
  2. ^ Groebe, D. R.; Uhlenbeck, O. C. (1988-12-23). “Characterization of RNA hairpin loop stability”. Nucleic Acids Research 16 (24): 11725–11735. doi:10.1093/nar/16.24.11725. ISSN 0305-1048. PMC: 339106. PMID 3211748. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/3211748. 
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  5. ^ 鈴木, 洋 (2015-08-25) (日本語), マイクロRNA, 公益社団法人日本生化学会, doi:10.14952/seikagaku.2015.870413, https://doi.org/10.14952/SEIKAGAKU.2015.870413 2019年12月18日閲覧。 
  6. ^ Alberts, Bruce; Johnson, Alexander; Lewis, Julian; Raff, Martin; Roberts, Keith; Walter, Peter (2002). “From RNA to Protein” (英語). Molecular Biology of the Cell. 4th edition. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK26829/. 
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  9. ^ Meyer, Michelle; Deiorio-Haggar K; Anthony J (July 2013). “RNA structures regulating ribosomal protein biosynthesis in bacilli”. RNA Biology. 7 10: 1160–1164. doi:10.4161/rna.24151. PMC: 3849166. PMID 23611891. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3849166/. 
  10. ^ Malys N, Nivinskas R (2009). “Non-canonical RNA arrangement in T4-even phages: accommodated ribosome binding site at the gene 26-25 intercistronic junction”. Mol Microbiol 73 (6): 1115–1127. doi:10.1111/j.1365-2958.2009.06840.x. PMID 19708923. 
  11. ^ Malys N, McCarthy JEG (2010). “Translation initiation: variations in the mechanism can be anticipated”. Cellular and Molecular Life Sciences 68 (6): 991–1003. doi:10.1007/s00018-010-0588-z. PMID 21076851. 
  12. ^ Gusarov, I.; Nudler, E. (1999-04). “The mechanism of intrinsic transcription termination”. Molecular Cell 3 (4): 495–504. doi:10.1016/s1097-2765(00)80477-3. ISSN 1097-2765. PMID 10230402. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10230402. 


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