配列バリアントとは? わかりやすく解説

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配列バリアント

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/05/26 09:41 UTC 版)

ヒストンH2A」の記事における「配列バリアント」の解説

ヒストンH2Aは非対立遺伝子バリアントから構成される。「ヒストンH2A」という用語は、密接に関連したさまざまなバリアント包括的に指して用いられる。これらのバリアント多く場合アミノ酸差異しか存在しない特筆すべきバリアントとしては、H2A.1、H2A.2、H2A.X(英語版)、H2A.Z(英語版)がある。H2Aバリアントは"HistoneDB with Variants" databaseで検索することができる。 細胞分化によってバリアント構成には変化生じる。神経細胞分化過程では、合成ターンオーバー変化によってバリアント構成変化生じることが観察されている。神経細胞分化過程唯一一定して存在するバリアントはH2A.Zである。H2A.Zは従来型H2Aコアタンパク質に置き換わり、遺伝子サイレンシング重要な役割を果たす近年の研究では、H2A.ZはSwi2/Snf2関連ATPアーゼであるSwr1を用いてヌクレオソーム組み込まれることが示唆されている。 同定されている他のH2AバリアントしてはH2A.Xがある。このバリアントC末端領域長くDNA修復利用される。このバリアント利用する修復方法非相同末端結合(NHEJ)であり、DNA損傷直接的にこのバリアントへの変換誘導する電離放射線用いた実験によって、リン酸化されたH2A.X(γH2A.X)とDNA二本切断との関係が示されており、DNA損傷応答してγH2A.Xが形成される。 MacroH2AはH2A類似したバリアントであり、H2AFY(英語版遺伝子によってコードされる。このバリアントC末端テールフォールディングしたドメイン付加されている点でH2Aとは異なる。MacroH2Aはメス不活性化されたX染色体位置している。

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配列バリアント

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/03/31 15:44 UTC 版)

ヒストンH4」の記事における「配列バリアント」の解説

ヒストンは最も進化の遅いタンパク質1つである。ヒストンH4には配列バリアントが存在せず、H4の遺伝子細胞周期通じて構成的発現して同一な配列コードすると考えられてきた。しかし近年になってヒト科特異的バリアントH4Gが同定された。

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