配列と構造
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2018/04/18 20:00 UTC 版)
Nkx2.5は主としてTN(tinman)ドメイン、ホメオドメイン(ホメオボックス)、NK2(NK-2-SD)ドメインの3つのドメインから構成される。TNドメインは10アミノ酸残基の長さで、他のタンパク質との相互作用に利用されるとされる。ホメオドメインは60アミノ酸残基の長さがありヘリックス・ターン・ヘリックス構造を有するDNAへの結合部位である。NK2ドメインはtinmanにはないドメインで、これも他のタンパク質との相互作用に役立つと考えられている。
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配列と構造
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2022/03/20 10:05 UTC 版)
哺乳類のMef2遺伝子は全て、全体として約50%のアミノ酸同一性がみられる。高度に保存されたN末端のMADSボックスとMef2ドメインでは約95%の類似性がみられる一方で、C末端のトランス活性化ドメインの配列は多様である。 MADSボックスはDNA結合に最小限必要なドメインとして機能するが、高親和性のDNA結合と二量体化にはMef2ドメインと呼ばれる隣接した29アミノ酸のドメインが必要である。MADSボックスとの相互作用を介して、Mef2転写因子はホモ二量体化またはヘテロ二量体化を行う。MEF2A、MEF2C、MEF2DのC末端には古典的核局在化配列(NLS)が存在し、タンパク質の核局在を保証している。ショウジョウバエのMef2やヒトのMEF2Bにはこの保存されたNLSは存在しないが、核内に存在する。
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