Peridininとは？わかりやすく解説

ペリジニン
	IUPAC名 Acetic acid [(1S,3R)-3-hydroxy-4-[(3E,5E,7E,9E,11Z)-11-[4-[(E)-2-[(1S,4S,6R)-4-hydroxy-2,2,6-trimethyl-7-oxabicyclo[4.1.0]heptan-1-yl]vinyl]-5-oxo-2-furylidene]-3,10-dimethylundeca-1,3,5,7,9-pentaenylidene]-3,5,5-trimethylcyclohexyl] ester
識別情報
CAS登録番号	33281-81-1
PubChem	5289155
	SMILES [H][C@@](/[C@@](C)=C/C=C/C=C/C=C(C)/C=C2C=C(/C=C/[C@@]3(O4)[C@]4(C)C[C@@H](O)CC(C)3C)C(O\2)=O)=C=C1[C@](C)(O)C[C@@H](OC(C)=O)CC(C)1C ;
特性
化学式	C39H50O7
モル質量	630.81 g mol−1
	特記なき場合、データは常温 (25 °C)・常圧 (100 kPa) におけるものである。

ペリジニン(Peridinin)は、集光カロテノイド、つまりクロロフィルに共存する色素である。渦鞭毛藻のペリジニン-クロロフィル-タンパク質(PCP)光収穫複合体で見られ、Amphidinium carteraeで最も良く研究されている^[1]。

構造

ペリジニン-クロロフィル-タンパク質光収穫複合体。ペリジニン分子はピンク色で、クロロフィル分子は黒色で表されている。

PCP複合体は、ペリジニンのクロロフィルに対する高い比率が特徴である。大部分の光収穫複合体はペリジニンよりもクロロフィルを多く含むが、PCPでは8つのペリジニン分子と2つのクロロフィル分子が、ペリジニン-クロロフィル間のエネルギー伝達を促進するように並んでいる。PCP複合体は、分子量35kDaで、珍しいαソレノイド構造の三量体タンパク質である。

スペクトル

ペリジニンクロロフィル(PerCP)の放出及び励起スペクトル

極大吸収: 483 nm<
極大放射: 676 nm
減衰係数 (ε): 1.96 x 10⁶M⁻¹cm⁻¹
A₄₈₃/A₂₈₀ ≥ 4.6

応用

ペリジニンクロロフィル(PerCP)は、蛍光活性化セルソーターやフローサイトメトリー等の免疫学的検定によく用いられる。蛍光色素分子はタンパク質または抗体と共有結合し、研究に用いられる^[2]。

出典

^ Hofmann E, Wrench PM, Sharples FP, Hiller RG, Welte W, Diederichs K (1996). “Structural basis of light harvesting by carotenoids: peridinin-chlorophyll-protein from Amphidinium carterae”. Science 272 (5269): 1788–1791. doi:10.1126/science.272.5269.1788. PMID 8650577.
^ [1]

[1] Hofmann E, Wrench PM, Sharples FP, Hiller RG, Welte W, Diederichs K (1996). “Structural basis of light harvesting by carotenoids: peridinin-chlorophyll-protein from Amphidinium carterae”. Science 272 (5269): 1788–1791. doi:10.1126/science.272.5269.1788. PMID 8650577.

[2] [1]

[1]

[2]

分子式：	C₃₉H₅₀O₇
その他の名称：	ペリジニン、Peridinin、5-[(1Z,2E,4E,6E,8E)-11-[(2R,4S)-4-(Acetyloxy)-2-hydroxy-2,6,6-trimethylcyclohexylidene]-2,9-dimethyl-2,4,6,8,10-undecapentenylidene]-3-[(E)-2-[(1S)-4α-hydroxy-2,2,6α-trimethyl-7-oxabicyclo[4.1.0]heptane-1α-yl]ethenyl]furan-2(5H)-one、5-[(1Z,2E,4E,6E,8E)-11-[(2R)-2α-Hydroxy-4β-acetoxy-2,6,6-trimethylcyclohexylidene]-2,9-dimethyl-2,4,6,8,10-undecapentenylidene]-3-[(E)-2-[(1S)-4α-hydroxy-2,2,6α-trimethyl-7-oxabicyclo[4.1.0]heptane-1α-yl]ethenyl]furan-2(5H)-one、(-)-ペリジニン、(-)-Peridinin
体系名：	5-[(1Z,2E,4E,6E,8E)-11-[(2R,4S)-4-(アセチルオキシ)-2-ヒドロキシ-2,6,6-トリメチルシクロヘキシリデン]-2,9-ジメチル-2,4,6,8,10-ウンデカペンタエニリデン]-3-[(E)-2-[(1S)-4α-ヒドロキシ-2,2,6α-トリメチル-7-オキサビシクロ[4.1.0]ヘプタン-1α-イル]エテニル]フラン-2(5H)-オン、5-[(1Z,2E,4E,6E,8E)-11-[(2R)-2α-ヒドロキシ-4β-アセトキシ-2,6,6-トリメチルシクロヘキシリデン]-2,9-ジメチル-2,4,6,8,10-ウンデカペンタエニリデン]-3-[(E)-2-[(1S)-4α-ヒドロキシ-2,2,6α-トリメチル-7-オキサビシクロ[4.1.0]ヘプタン-1α-イル]エテニル]フラン-2(5H)-オン

表話編歴カロテノイド
カロテン (C₄₀)	α-カロテン · β-カロテン · γ-カロテン · δ-カロテン · ε-カロテン · ζ-カロテン · リコペン · ニューロスポレン · フィトエン · フィトフルエン
キサントフィル (C₄₀)	アンテラキサンチン · アスタキサンチン · カンタキサンチン · シトラナキサンチン · β-クリプトキサンチン · ジアジノキサンチン · ジアトキサンチン · ジノキサンチン · フラボキサンチン · フコキサンチン · ルテイン · ネオキサンチン · ロドキサンチン · ルビキサンチン · ビオラキサンチン · ゼアキサンチン
アポカロテノイド (C_<40)	アブシシン酸 · アポカロテナール · ビキシン · クロセチン · イオノン · ペリジニン
ビタミンA レチノイド (C₂₀)	レチナール · レチノイン酸 · レチノール


	All Rights Reserved, Copyright © Japan Science and Technology Agency
	All text is available under the terms of the GNU Free Documentation License. この記事は、ウィキペディアのペリジニン (改訂履歴)の記事を複製、再配布したものにあたり、GNU Free Documentation Licenseというライセンスの下で提供されています。 Weblio辞書に掲載されているウィキペディアの記事も、全てGNU Free Documentation Licenseの元に提供されております。

Peridininとは？ わかりやすく解説

ペリジニン

ペリジニン

構造

スペクトル

応用

出典

「Peridinin」の関連用語

Peridininとは？わかりやすく解説