GC含量とは? わかりやすく解説

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GC含量

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2020/06/20 18:06 UTC 版)

GC含量(GCがんりょう、GC-content)は、DNA分子中の窒素塩基のうちグアニンシトシンの割合である[1]。また、この用語はDNAやRNAの特定の断片や、ゲノム全体に対しても用いられる。


  1. ^ Definition of GC – content on CancerWeb of Newcastle University,UK
  2. ^ Yakovchuk P, Protozanova E, Frank-Kamenetskii MD (2006). “Base-stacking and base-pairing contributions into thermal stability of the DNA double helix”. Nucleic Acids Res. 34 (2): 564–74. doi:10.1093/nar/gkj454. PMC: 1360284. PMID 16449200. http://nar.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=16449200. 
  3. ^ Yakovchuk, Peter; Protozanova, Ekaterina; Frank-Kamenetskii, Maxim D. (2006). “Base-stacking and base-pairing contributions into thermal stability of the DNA double helix”. Nucleic Acids Research 34 (2): 564–574. doi:10.1093/nar/gkj454. ISSN 1362-4962. PMC: 1360284. PMID 16449200. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16449200. 
  4. ^ Levin RE, Van Sickle C (1976). “Autolysis of high-GC isolates of Pseudomonas putrefaciens”. Antonie Van Leeuwenhoek 42 (1–2): 145–55. doi:10.1007/BF00399459. PMID 7999. 
  5. ^ Hurst LD, Merchant AR (March 2001). “High guanine-cytosine content is not an adaptation to high temperature: a comparative analysis amongst prokaryotes”. Proc. Biol. Sci. 268 (1466): 493–7. doi:10.1098/rspb.2000.1397. PMC: 1088632. PMID 11296861. http://journals.royalsociety.org/openurl.asp?genre=article&issn=0962-8452&volume=268&issue=1466&spage=493. 
  6. ^ Zheng H, Wu H (December 2010). “Gene-centric association analysis for the correlation between the guanine-cytosine content levels and temperature range conditions of prokaryotic species”. BMC Bioinformatics 11: S7. doi:10.1186/1471-2105-11-S11-S7. PMC: 3024870. PMID 21172057. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3024870/. 
  7. ^ Madigan,MT. and Martinko JM. (2003). Brock biology of microorganisms (10th ed.). Pearson-Prentice Hall. ISBN 84-205-3679-2 
  8. ^ Definition of GC-ratio on Northwestern University, IL, USA
  9. ^ Wilhelm J, Pingoud A, Hahn M (May 2003). “Real-time PCR-based method for the estimation of genome sizes”. Nucleic Acids Res. 31 (10): e56. doi:10.1093/nar/gng056. PMC: 156059. PMID 12736322. http://nar.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=12736322. 
  10. ^ Vinogradov AE (May 1994). “Measurement by flow cytometry of genomic AT/GC ratio and genome size”. Cytometry 16 (1): 34–40. doi:10.1002/cyto.990160106. PMID 7518377. 
  11. ^ Bernardi G (January 2000). “Isochores and the evolutionary genomics of vertebrates”. Gene 241 (1): 3–17. doi:10.1016/S0378-1119(99)00485-0. PMID 10607893. http://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0378-1119(99)00485-0. 
  12. ^ Furey TS, Haussler D (May 2003). “Integration of the cytogenetic map with the draft human genome sequence”. Hum. Mol. Genet. 12 (9): 1037–44. doi:10.1093/hmg/ddg113. PMID 12700172. http://hmg.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=12700172. 
  13. ^ Sumner AT, de la Torre J, Stuppia L (August 1993). “The distribution of genes on chromosomes: a cytological approach”. J. Mol. Evol. 37 (2): 117–22. doi:10.1007/BF02407346. PMID 8411200. 
  14. ^ Aïssani B, Bernardi G (October 1991). “CpG islands, genes and isochores in the genomes of vertebrates”. Gene 106 (2): 185–95. doi:10.1016/0378-1119(91)90198-K. PMID 1937049. 
  15. ^ Pozzoli U, Menozzi G, Fumagalli M, et al (2008). “Both selective and neutral processes drive GC content evolution in the human genome”. BMC Evol. Biol. 8: 99. doi:10.1186/1471-2148-8-99. PMC: 2292697. PMID 18371205. http://www.biomedcentral.com/1471-2148/8/99. 
  16. ^ Wuitschick JD, Karrer KM (1999). “Analysis of genomic G + C content, codon usage, initiator codon context and translation termination sites in Tetrahymena thermophila”. J. Eukaryot. Microbiol. 46 (3): 239–47. doi:10.1111/j.1550-7408.1999.tb05120.x. PMID 10377985. 
  17. ^ Birdsell JA (1 July 2002). “Integrating genomics, bioinformatics, and classical genetics to study the effects of recombination on genome evolution”. Mol. Biol. Evol. 19 (7): 1181–97. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a004176. PMID 12082137. http://mbe.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=12082137. 
  18. ^ International Human Genome Sequencing Consortium (Feb 2001). “Initial sequencing and analysis of the human genome”. Nature 409 (6822): 860–921. Bibcode2001Natur.409..860L. doi:10.1038/35057062. PMID 11237011.  (page 876)
  19. ^ Saccharomyces cerevisiae S288c (ID 128) - BioProject - NCBI”. www.ncbi.nlm.nih.gov. 2020年6月20日閲覧。
  20. ^ Arabidopsis thaliana (ID 116) - BioProject - NCBI”. www.ncbi.nlm.nih.gov. 2020年6月20日閲覧。
  21. ^ Plasmodium falciparum 3D7 (ID 148) - BioProject - NCBI”. www.ncbi.nlm.nih.gov. 2020年6月20日閲覧。
  22. ^ “Compositional constraints in the extremely GC-poor genome of Plasmodium falciparum. Mem. Inst. Oswaldo Cruz 92 (6): 835–41. (1997). doi:10.1590/S0074-02761997000600020. PMID 9566216. http://www.scielo.br/pdf/mioc/v92n6/3431.pdf. 
  23. ^ Romiguier, Jonathan; Ranwez, Vincent; Douzery, Emmanuel J. P.; Galtier, Nicolas (2010-08-01). “Contrasting GC-content dynamics across 33 mammalian genomes: Relationship with life-history traits and chromosome sizes” (英語). Genome Research 20 (8): 1001–1009. doi:10.1101/gr.104372.109. ISSN 1088-9051. PMC: 2909565. PMID 20530252. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2909565/. 
  24. ^ “Biased gene conversion and the evolution of mammalian genomic landscapes”. Annu Rev Genom Hum Genet 10: 285–311. (2009). doi:10.1146/annurev-genom-082908-150001. PMID 19630562. 
  25. ^ Wayne LG, et al (1987). “Report of the ad hoc committee on reconciliation of approaches to bacterial systematic”. International journal of systematic bacteriology 37 (4): 463–4. doi:10.1099/00207713-37-4-463. 
  26. ^ Taxonomy browser (Actinobacteria)”. www.ncbi.nlm.nih.gov. 2020年6月20日閲覧。
  27. ^ Streptomyces coelicolor A3(2) strain:A3(2) (ID 242) - BioProject - NCBI”. www.ncbi.nlm.nih.gov. 2020年6月20日閲覧。


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