オープンリーディングフレーム
英訳・(英)同義/類義語：open reading frame, ORF
一つのアミノ酸が３塩基で規定されることから、三塩基を一組としてゲノムDNAを区切った一連の塩基の組や範囲で終始コドンから次の終始コドンまでの間の読み枠。
一つのアミノ酸が３塩基で規定されることから、三塩基を一組としてゲノムDNAを区切った一連の塩基の組や範囲で終始コドンから次の終始コドンまでの間の読み枠。
読み枠
オープンリーディングフレーム
(open reading frame から転送)
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2023/01/10 16:28 UTC 版)
分子遺伝学において、オープンリーディングフレーム（英: open reading frame、ORF）とは、翻訳される能力を持つリーディングフレームの部分のことである[1]。ORFとは、開始コドン（通常はAUG）で始まり、終止コドン（通常はUAA、UAG、UGA）で終わるコドンの連続した一続きである[2]。ORF（必ずしも最初のものとは限らない）内のATGコドン（RNAで言うAUG）は、翻訳が開始される場所を示している可能性がある。転写終結部位は、ORFの後に、翻訳終止コドンの先にある。もし、転写が終止コドンの手前で止まると、翻訳時に不完全なタンパク質が作られる[3]。複数のエクソンを持つ真核生物の遺伝子では、転写後にイントロンが除去され、エクソンが結合されて、タンパク質翻訳のための最終的なmRNAが生成される。イントロンには終止コドンが含まれていたり、リーディングフレーム間のずれが発生する可能性があるため、遺伝子予測（gene prediction）においては、ORFの開始-終止の定義は、ゲノムDNAではなく、スプライスされたmRNAにのみ適用される。別の定義は、ORFは3で割り切れる長さを持ち、終止コドンで囲まれた配列である[4][5]。この、より一般的な定義は、トランスクリプトミクスおよび(または)メタゲノミクスの分野においても有用であり、得られた配列に開始コドン/終止コドンが存在しない場合もある。このようなORFは、完全な遺伝子ではなく、遺伝子の一部に対応する。
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[続きの解説]
「オープンリーディングフレーム」の続きの解説一覧
- 1 オープンリーディングフレームとは
- 2 オープンリーディングフレームの概要
- 3 脚注
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