科学的解釈
出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2014/05/24 05:58 UTC 版)
中立説のモデルに従うと、平衡状態にあるサイズ一定の集団では次の式が成り立つ。 二倍体の場合、 上記の式における は多型サイトの数、nはサンプルの数である。 しかし、自然選択や個体数の変化、その他の中立モデルから逸脱する効果(種間交雑、遺伝子移入等も含む) が集団に働くと、 や の期待値を変化させると推測され、二つの値が 等しいとは言えなくなる。Tajima's D testにおいて重要なポイントは、これら二つの変数の期待値の差 (正の値と負の値のどちらも取り得る)である。 統計量 は、集団遺伝学のパラメータの二つの推定値の差から 計算される。この差をと表すと、は、をその分散の 平方根(すなわち、標準偏差)で割ることで計算される。 つまり、 田嶋文生は、統計量 がベータ分布に近似されることをシミュレーションにより 明らかにした。 DNA配列標本から得られるが信頼区間外であれば、「注目している サンプルセットが中立的に進化してきた」という帰無仮説は棄却される。
※この「科学的解釈」の解説は、「Tajima's D」の解説の一部です。
「科学的解釈」を含む「Tajima's D」の記事については、「Tajima's D」の概要を参照ください。
- 科学的解釈のページへのリンク