岡崎フラグメントとは? わかりやすく解説

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岡崎フラグメント

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岡崎フラグメント

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2024/10/12 01:18 UTC 版)

岡崎フラグメント(おかざきフラグメント)は、DNA複製におけるラギング鎖の合成時にDNAプライマーゼDNAポリメラーゼIIIによって形成される比較的短いDNA断片(フラグメント)である。

分子生物学者の岡崎令治岡崎恒子により1967年に発見された。

なお、当初は新生短鎖と呼称されていた[1]

概要

ラギング鎖(a下)からみて複製フォーク (d) は遠ざかっていくため、DNA合成が段階的に行われる。このとき合成される短いDNA断片 (c) を岡崎フラグメントという

DNAは複製される際に、二重らせんがほどかれ、相補鎖がDNAヘリカーゼによって分離されると、DNAプライマーゼDNAポリメラーゼが作用し、新しい相補鎖を作成する。DNAポリメラーゼによるDNAの合成は、5' から 3' への方向にしか行えないが、ラギング鎖では 3' から 5' への方向の合成を必要とする[2]。そのためDNA合成は段階的に行われる。まずDNAプライマーゼによって数塩基の短いRNAプライマー)が合成され、続いて、その 3' 末端からDNAポリメラーゼIIIによってDNAが合成される(ただし真核生物はDNAポリメラーゼδ、クレン古細菌はDNAポリメラーゼB、ユーリ古細菌はDNAポリメラーゼDを使用する)。こうしてできるのが岡崎フラグメントである。岡崎フラグメントの長さは、真正細菌では1000 - 2000塩基程度、真核生物及び古細菌では100 - 200塩基程度である。

このあとRNA部分がRNアーゼHによって分解され、DNAポリメラーゼIによって分解およびDNAの再合成を受ける。断片の間に残ったニック(ホスホジエステル結合が切れている部分)はDNAリガーゼによって結合される。

実験

岡崎令治と岡崎恒子は、大腸菌の体内でDNA複製を行う実験を行った。まず、大腸菌に放射性チミジンを取り込ませた(パルス標識[1][3]。しかし、DNA複製は一つの細胞内で1,000ヌクレオチド/秒という早さで行われているため、低温にし、反応スピードを下げ、標識時間を短くし、放射性チミジンを観察した[1]。結果、1,000 - 2,000塩基対の短いDNAを抽出した。これはラギング鎖において、不連続複製が行われている可能性を意味する。

その後、アメリカ滞在中に大腸菌やT4ファージ内からDNAリガーゼが発見され、DNAリガーゼが作用する条件下と作用しない条件下で標識実験を行い、DNAリガーゼが作用しない条件下では長鎖の形成が抑えられて短鎖が蓄積することを確認し、仮説をより有力なものとした[1]

脚注

  1. ^ a b c d 岡崎フラグメントと私”. 生命誌研究会. 2021年11月13日閲覧。
  2. ^ Ogawa, T.; Okazaki, T. (1980). “Discontinuous DNA transcription” (英語). Annual Review of Biochemistry 49: 421–57. doi:10.1146/annurev.bi.49.070180.002225. PMID 6250445. 
  3. ^ Okazaki, R.; Okazaki, T.; Sakabe, K.; Sugimoto, K.; Sugino, A. (1968-02). “Mechanism of DNA chain growth. I. Possible discontinuity and unusual secondary structure of newly synthesized chains” (英語). Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 59 (2): 598–605. Bibcode1968PNAS...59..598O. doi:10.1073/pnas.59.2.598. PMC 224714. PMID 4967086. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC224714/. 

岡崎フラグメント

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/09/14 14:54 UTC 版)

日本の発明・発見の一覧」の記事における「岡崎フラグメント」の解説

岡崎フラグメントは、DNA複製の際にラギング鎖新しく形成される短いDNA断片フラグメント)である。岡崎フラグメントはラギング鎖相補的な役割果たし二本の短いDNA鎖を一緒に形成する一連の実験により、岡崎フラグメントが発見された。実験は、1960 年代岡崎令治岡崎恒子坂部和子、その同僚によって、大腸菌DNA複製研究行われた1966 年坂部和子岡崎令治は、DNA 複製断片を含む不連続な過程であることを初め示した大腸菌におけるバクテリオファージDNA複製関連する研究通じて研究者及び同僚によってさらに研究された。

※この「岡崎フラグメント」の解説は、「日本の発明・発見の一覧」の解説の一部です。
「岡崎フラグメント」を含む「日本の発明・発見の一覧」の記事については、「日本の発明・発見の一覧」の概要を参照ください。

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