TaqManプローブ法とは? わかりやすく解説

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TaqManプローブ法

出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』 (2021/02/16 00:28 UTC 版)

リアルタイムPCR」の記事における「TaqManプローブ法」の解説

配列特異的なオリゴヌクレオチド5'末端レポーター3'末端にクエンチャーを標識したプローブ用い方法である。Realtime PCRではレポーター蛍光物質検出することで増幅確認するレポーターにはFITCやVIC用いることが多い。一方、クエンチャーはレポーター蛍光蛍光共鳴エネルギー転移FRET)により消光させる標識物で、従来TAMARAなどの蛍光物が用いられることが多かった。この場合レポーターから受け取ったエネルギーを光として放出していたが、最近はEclipseやDABCYL、MGBなどのエネルギーを熱に変えるダーククエンチャーが用いられることが多い。後者利点として、バックグランドが低いことが挙げられるFRETはクエンチャーとレポーターの距離が離れると起こらなくなりレポーターから蛍光が発せられるPCR反応がすすみ、Taq DNAポリメラーゼの5'→3'エキソヌクレアーゼ活性によりハイブリダイズされていたTaqManプローブ加水分解されるレポーターとクエンチャーの距離が離れ蛍光シグナルが発せられ、これを検出することでPCR産物量を定量することが出来る。TaqManプローブ法の利点は、特異的な配列をもつ蛍光プローブ用いるため、SYBR Green法のようなプライマー二量体非特異的検出がない点で特異度にすぐれる。また、複数プローブ別の蛍光物質標識しておけば、マルチプレックス解析を行うことも可能である。欠点としては、蛍光プローブ検出する配列ごとに設計合成しなければならないため、SYBR Green法よりも費用手間がかかることが挙げられる

※この「TaqManプローブ法」の解説は、「リアルタイムPCR」の解説の一部です。
「TaqManプローブ法」を含む「リアルタイムPCR」の記事については、「リアルタイムPCR」の概要を参照ください。

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