RNA結合タンパク質
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2020/03/14 00:11 UTC 版)
RNA結合タンパク質（RNAけつごうタンパクしつ、英: RNA-binding protein）は、細胞内の一本鎖または二本鎖RNAに結合するタンパク質で[1]、リボヌクレオタンパク質複合体の形成に関与する。RBPと略されることもある。RNA結合タンパク質には、RNA認識モチーフ（RRM）、二本鎖RNA結合ドメイン、ジンクフィンガーなど、さまざまな構造モチーフが含まれる[2]。RNA結合タンパク質は核内にも細胞質にも存在する。成熟したRNAの大部分は核外へ比較的迅速に搬出されるため、核内のRNA結合タンパク質の大部分は、ヘテロ核リボヌクレオタンパク質（hnRNP）と呼ばれる、タンパク質とpre-mRNA（mRNA前駆体）の複合体として存在する。RNA結合タンパク質は、細胞機能や輸送、局在化などさまざまな過程に重要な役割を果たす。特に大きな役割を果たすのは、スプライシング、ポリアデニル化、mRNAの安定化、局在化、翻訳など、RNAの転写後の過程の制御である。真核生物の細胞では多様なRNA結合タンパク質が約500の遺伝子にコードされており、それぞれが固有のRNA結合活性とタンパク質間相互作用を持つ。RNA結合タンパク質の多様性は、進化の過程でイントロン数の増加とともに大きく増大した。その結果、真核細胞はエクソンをさまざまな組み合わせで利用できるようになり、それぞれのRNAに固有のリボヌクレオタンパク質が形成される。RNA結合タンパク質は遺伝子発現の転写後調節に重要な役割を果たしているものの、体系的な研究が行われているタンパク質は比較的少数である[3][4]。
- ^ RNA-Binding Proteins - MeSH、米国国立医学図書館、生命科学用語シソーラス (英語サイト)
- ^ a b “RNA-binding proteins: modular design for efficient function”. Nature Reviews. Molecular Cell Biology 8 (6): 479–90. (June 2007). doi:10.1038/nrm2178. PMC: 5507177. PMID 17473849.
- ^ “Diverse RNA-binding proteins interact with functionally related sets of RNAs, suggesting an extensive regulatory system”. PLoS Biology 6 (10): e255. (October 2008). doi:10.1371/journal.pbio.0060255. PMC: 2573929. PMID 18959479.
- ^ a b c d e f g h “RNA-binding proteins and post-transcriptional gene regulation”. FEBS Letters 582 (14): 1977–86. (June 2008). doi:10.1016/j.febslet.2008.03.004. PMC: 2858862. PMID 18342629.
- ^ a b “Non-coding RNAs: lessons from the small nuclear and small nucleolar RNAs”. Nature Reviews. Molecular Cell Biology 8 (3): 209–20. (March 2007). doi:10.1038/nrm2124. PMID 17318225.
- ^ “Context-dependent control of alternative splicing by RNA-binding proteins”. Nature Reviews. Genetics 15 (10): 689–701. (October 2014). doi:10.1038/nrg3778. PMC: 4440546. PMID 25112293.
- ^ “A direct role for FMRP in activity-dependent dendritic mRNA transport links filopodial-spine morphogenesis to fragile X syndrome”. Developmental Cell 14 (6): 926–39. (June 2008). doi:10.1016/j.devcel.2008.04.003. PMC: 2453222. PMID 18539120.
- ^ a b c d Lee, Min-Ho; Schedl, Tim (18 April 2006). “RNA-binding proteins”. WormBook. pp. 1–13.
- ^ a b c d “RNA sequence- and shape-dependent recognition by proteins in the ribonucleoprotein particle”. EMBO Reports 6 (1): 33–8. (January 2005). doi:10.1038/sj.embor.7400325. PMC: 1299235. PMID 15643449.
- ^ Appasani, Krishnarao (2008). MicroRNAs: From Basic Science to Disease Biology. Cambridge University Press. p. 485. ISBN 978-0-521-86598-2.
- ^ “RNA-binding proteins as developmental regulators”. Genes & Development 3 (4): 431–7. (April 1989). doi:10.1101/gad.3.4.431. PMID 2470643.
- ^ “Zipcode binding protein 1 regulates the development of dendritic arbors in hippocampal neurons”. The Journal of Neuroscience 31 (14): 5271–85. (April 2011). doi:10.1523/JNEUROSCI.2387-10.2011. PMID 21471362.
- ^ “Nanos and Pumilio are essential for dendrite morphogenesis in Drosophila peripheral neurons”. Current Biology 14 (4): 314–21. (February 2004). doi:10.1016/j.cub.2004.01.052. PMID 14972682.
- ^ “A loss of function allele for murine Staufen1 leads to impairment of dendritic Staufen1-RNP delivery and dendritic spine morphogenesis”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 105 (42): 16374–9. (October 2008). Bibcode: 2008PNAS..10516374V. doi:10.1073/pnas.0804583105. JSTOR 25465098. PMC: 2567905. PMID 18922781.
- ^ a b c d “Comprehensive Genomic Characterization of RNA-Binding Proteins across Human Cancers”. Cell Reports 22 (1): 286–298. (January 2018). doi:10.1016/j.celrep.2017.12.035. PMID 29298429.
- ^ “Multiple functions of the RNA-binding protein HuR in cancer progression, treatment responses and prognosis”. International Journal of Molecular Sciences 14 (5): 10015–41. (May 2013). doi:10.3390/ijms140510015. PMC: 3676826. PMID 23665903.
- ^ “The RNA-binding protein Sam68 is a multifunctional player in human cancer”. Endocrine-Related Cancer 18 (4): R91-R102. (August 2011). doi:10.1530/ERC-11-0041. PMID 21565971.
- ^ “High expression level and nuclear localization of Sam68 are associated with progression and poor prognosis in colorectal cancer”. BMC Gastroenterology 13: 126. (August 2013). doi:10.1186/1471-230X-13-126. PMC: 3751151. PMID 23937454.
- ^ “SAM68: Signal Transduction and RNA Metabolism in Human Cancer”. BioMed Research International 2015: 528954. (26 July 2015). doi:10.1155/2015/528954. PMC: 4529925. PMID 26273626.
- ^ “Posttranscriptional regulation of cancer traits by HuR”. Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA 1 (2): 214–29. (1 September 2010). doi:10.1002/wrna.4. PMC: 3808850. PMID 21935886.
- ^ “The RNA binding protein FXR1 is a new driver in the 3q26-29 amplicon and predicts poor prognosis in human cancers”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 112 (11): 3469–74. (March 2015). Bibcode: 2015PNAS..112.3469Q. doi:10.1073/pnas.1421975112. PMC: 4371932. PMID 25733852.
- ^ a b c “Large-scale analysis of genome and transcriptome alterations in multiple tumors unveils novel cancer-relevant splicing networks”. Genome Research 26 (6): 732–44. (June 2016). doi:10.1101/gr.199935.115. PMC: 4889968. PMID 27197215.
- ^ “Frequent pathway mutations of splicing machinery in myelodysplasia”. Nature 478 (7367): 64–9. (September 2011). Bibcode: 2011Natur.478...64Y. doi:10.1038/nature10496. PMID 21909114.
- ^ “Mapping the hallmarks of lung adenocarcinoma with massively parallel sequencing” (English). Cell 150 (6): 1107–20. (September 2012). doi:10.1016/j.cell.2012.08.029. PMC: 3557932. PMID 22980975.
- ^ “Whole-genome analysis informs breast cancer response to aromatase inhibition”. Nature 486 (7403): 353–60. (June 2012). Bibcode: 2012Natur.486..353E. doi:10.1038/nature11143. PMC: 3383766. PMID 22722193.
- ^ “Alternative pre-mRNA splicing regulation in cancer: pathways and programs unhinged”. Genes & Development 24 (21): 2343–64. (November 2010). doi:10.1101/gad.1973010. PMC: 2964746. PMID 21041405.
- ^ “RNA-Binding Proteins: Splicing Factors and Disease”. Biomolecules 5 (2): 893–909. (May 2015). doi:10.3390/biom5020893. PMC: 4496701. PMID 25985083.
- ^ “Serial interactome capture of the human cell nucleus”. Nature Communications 7: 11212. (April 2016). Bibcode: 2016NatCo...711212C. doi:10.1038/ncomms11212. PMC: 4822031. PMID 27040163.
- ^ “Insights into RNA biology from an atlas of mammalian mRNA-binding proteins”. Cell 149 (6): 1393–406. (June 2012). doi:10.1016/j.cell.2012.04.031. PMID 22658674.
- ^ “The mRNA-bound proteome and its global occupancy profile on protein-coding transcripts”. Molecular Cell 46 (5): 674–90. (June 2012). doi:10.1016/j.molcel.2012.05.021. PMID 22681889.
- ^ “RNA-binding protein Sam68 controls synapse number and local β-actin mRNA metabolism in dendrites”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 110 (8): 3125–30. (February 2013). Bibcode: 2013PNAS..110.3125K. doi:10.1073/pnas.1209811110. PMC: 3581878. PMID 23382180.
- ^ Blumenthal, Tom, ed (2013). “CELF family RNA-binding protein UNC-75 regulates two sets of mutually exclusive exons of the unc-32 gene in neuron-specific manners in Caenorhabditis elegans”. PLoS Genetics 9 (2): e1003337. doi:10.1371/journal.pgen.1003337. PMC: 3585155. PMID 23468662.
- ^ Gallouzi, Imed Eddine, ed (2013). “NF-κB-dependent role for cold-inducible RNA binding protein in regulating interleukin 1β”. PLOS ONE 8 (2): e57426. Bibcode: 2013PLoSO...857426B. doi:10.1371/journal.pone.0057426. PMC: 3578848. PMID 23437386.
- ^ “SR-like RNA-binding protein Slr1 affects Candida albicans filamentation and virulence”. Infection and Immunity 81 (4): 1267–76. (April 2013). doi:10.1128/IAI.00864-12. PMC: 3639594. PMID 23381995.
[続きの解説]
「RNA結合タンパク質」の続きの解説一覧
- 1 RNA結合タンパク質とは
- 2 RNA結合タンパク質の概要
- 3 胚発生における役割
- 4 がんにおける役割
- 5 研究の現在
- 6 関連項目
このページでは「ウィキペディア」からRNA結合タンパク質を検索した結果を表示しています。
Weblioに収録されているすべての辞書からRNA結合タンパク質を検索する場合は、下記のリンクをクリックしてください。
全ての辞書からRNA結合タンパク質 を検索
Weblioに収録されているすべての辞書からRNA結合タンパク質を検索する場合は、下記のリンクをクリックしてください。
全ての辞書からRNA結合タンパク質 を検索 - RNA結合タンパク質のページへのリンク
