触媒残基に基づく分類
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2022/03/01 15:41 UTC 版)
「プロテアーゼ」の記事における「触媒残基に基づく分類」の解説
プロテアーゼは大きく分けて7つのグループに分類される。 セリンプロテアーゼ - セリンアルコールを使用 システインプロテアーゼ - システインチオールを使用 スレオニンプロテアーゼ（英語版） - スレオニン二級アルコールを使用 アスパラギン酸プロテアーゼ - アスパラギン酸カルボン酸を使用 グルタミン酸プロテアーゼ（英語版） - グルタミン酸カルボン酸を使用 金属プロテアーゼ (メタロプロテアーゼ) - 金属、通常は亜鉛を使用 アスパラギンペプチドリアーゼ（英語版） - アスパラギンを使用して脱離反応を行う (水を必要としない) プロテアーゼは、1993年に進化的関係に基づいて最初に84ファミリーに分類され、セリンプロテアーゼ、システインプロテアーゼ、アスパラギンプロテアーゼ、金属プロテアーゼの4つの触媒型に分類された。スレオニンプロテアーゼとグルタミン酸プロテアーゼは、それぞれ1995年と2004年まで記載されていなかった。ペプチド結合を切断する機構は、システインとスレオニンを持つアミノ酸残基 (プロテアーゼ) または水分子 (アスパラギン酸、金属プロテアーゼ、酸プロテアーゼ) がペプチドカルボキシル基を攻撃できるように求核性にすることである。求核試薬を作成する一つの方法は、ヒスチジン残基を用いてセリン、システイン、またはスレオニンを求核剤として活性化させる触媒三残基である。ただし、求核試薬の種類はさまざまなスーパーファミリーで収斂進化しており、一部のスーパーファミリーは複数の異なる求核試薬への分岐進化を示しているため、これは進化的なグループではない。
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