全ゲノムショットガン法

バイテク用語集

全ゲノムショットガン法

【英】： Whole-genome Shotgun Sequencing, Whole Genome Shotgun Sequencing

ゲノムの長鎖DNAの塩基配列決定法のことで、ホールゲノム・ショットガン法ともいわれる。

すべてのDNAを制限酵素（DNAを切断する酵素）で適当な断片に切断する。各々のDNA断片の両端の塩基配列を読んで、わずかな配列の重なりをコンピュータでつなぎ合わせていく。解読の精度の点では、階層化ショットガン法に比べ劣っているが、短時間でのゲノム解読を可能にする方法である。

自動DNAシーケンサー（塩基配列読み取り装置）の登場により、短期間に大量の塩基配列データが得られるようになった現在、微生物のゲノム塩基配列決定では主流の方法になっている。最近ではショウジョウバエのゲノム解析をホールゲノム・ショットガン法によって達成したと報告されている。

・ ショットガン法

・ ゲノム

・ デオキシリボ核酸

・ 塩基配列

・ 制限酵素

・ クローン

・ 遺伝子

・ 階層化ショットガン法