DNA結合領域
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2022/04/03 15:19 UTC 版)
転写因子は複数の機能領域から構成されるため、その構造解析は簡単ではない。しかし、実際にDNAに結合する部分であるDNA結合領域に基づく解析・分類は比較的進んでいる。以下に、代表的なDNA結合領域の分類を示す。 ホメオドメイン（homeodomain） ショウジョウバエの身体構造決定に関与する転写因子から見出されたモチーフで、ヒトを含む高等動物でもよく保存されている。ヘリックスターンヘリックス（HTH）構造を持ち、2番目のヘリックスがDNAを認識する。 ジンクフィンガー（zinc finger） ステロイドホルモン受容体などの核内受容体、GATAファミリー因子などに見られる構造で、亜鉛を配位することで特定の立体構造をとり、DNAに結合する。共通するアミノ酸配列に基づいて、C2H2タイプ、C4タイプなどに分類されている。 塩基性ヘリックスループヘリックス（basic-helix-loop-helix; bHLH） HLHはダイオキシン受容体や筋細胞分化に関わる転写因子に見られ、転写因子同士の結合に重要な構造である。二量体を形成した転写因子の、2つの塩基性領域がDNAを認識する。 塩基性ロイシンジッパー（basic region –leucine zipper; bZip） アミノ酸7つごとにロイシンあるいはイソロイシンが配置された特徴的なαヘリックス構造を持ち、転写因子の二量体形成に関わる。形成された二量体の塩基性領域がDNAを認識する。 他にWinged helix（WH）、ETSなどいくつかのモチーフが知られている。また、DNA結合領域を持たないために転写因子とは分類されないものの、転写調節に決定的な役割を持つタンパク質が存在する。補助活性化因子、クロマチン再構成複合体（Chromatin Structure Remodeling; RSC）、ヒストンアセチル基転移酵素、リン酸化酵素、メチル化酵素などが当てはまる。
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