U5 snRNA
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出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/02/20 01:02 UTC 版)
ナビゲーションに移動 検索に移動| U5 snRNA | |
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| 識別 | |
| 略称 | U5 |
| Rfam | RF00020 |
| その他のデータ | |
| リボ核酸の種類 | 遺伝子; snRNA; RNAスプライシング |
| ドメイン | 真核生物 |
| GO | 0000351 0000353 0005682 0046540 |
| SO | 0000395 |
| PDB構造 | PDBe |
U5 snRNA（U5 small nuclear RNA）は、スプライソソームの構成要素としてRNAスプライシングに関与するsnRNAである。いくつかのタンパク質を結合してU5 snRNPを形成するが、結合するタンパク質には、スプライソソームで最大かつ最も保存されたタンパク質であるPrp8、スプライソソームの活性化に必要なヘリカーゼであるBrr2、Snu114、7つのSmタンパク質が含まれる[1]。U5 snRNAは、スプライソソームの活性部位へ伸びる、同軸スタッキング（coaxial stacking）した一連のヘリックスからなる[2][3]。ループ1は一連のヘリックスのキャップとなり、スプライシングの2つの化学反応の間、5'エクソンと4–5塩基の塩基対を形成する[4][5]。この相互作用は、2段階目の反応であるエクソンのライゲーションの際に特に重要であるようである[6]。
出典
- ^ “Biochemical and genetic analyses of the U5, U6, and U4/U6 x U5 small nuclear ribonucleoproteins from Saccharomyces cerevisiae”. RNA 7 (11): 1543–53. (November 2001). PMC: 1370197. PMID 11720284.
- ^ “The architecture of the spliceosomal U4/U6.U5 tri-snRNP”. Nature 523 (7558): 47–52. (July 2015). doi:10.1038/nature14548. PMC: 4536768. PMID 26106855.
- ^ “Structure of a yeast spliceosome at 3.6-angstrom resolution”. Science 349 (6253): 1182–91. (September 2015). doi:10.1126/science.aac7629. PMID 26292707.
- ^ “U5 snRNA interacts with exon sequences at 5' and 3' splice sites”. Cell 68 (4): 743–54. (February 1992). doi:10.1016/0092-8674(92)90149-7. PMID 1739979.
- ^ “The U5 and U6 small nuclear RNAs as active site components of the spliceosome”. Science 262 (5142): 1989–96. (December 1993). doi:10.1126/science.8266094. PMID 8266094.
- ^ “The invariant U5 snRNA loop 1 sequence is dispensable for the first catalytic step of pre-mRNA splicing in yeast”. Cell 86 (4): 679–89. (August 1996). doi:10.1016/s0092-8674(00)80140-3. PMID 8752221.
関連文献
- “The uRNA database”. Nucleic Acids Research 25 (1): 102–3. (January 1997). doi:10.1093/nar/25.1.102. PMC: 146409. PMID 9016512.
- “The spliceosomal snRNAs of Caenorhabditis elegans”. Nucleic Acids Research 18 (9): 2633–42. (May 1990). doi:10.1093/nar/18.9.2633. PMC: 330746. PMID 2339054.
外部リンク
U5 snRNP
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「Pre-mRNA スプライシング」の記事における「U5 snRNP」の解説
U5 snRNPはイントロン第二の反応を成功させるように、イントロン両側のエクソンと相互作用して接近させる。U5 snRNPにはどのsnRNPともmRNA前駆体とも相補的な配列がない。SontheimerとSteitzの実験によると、第二スプライシング反応で5'末端から39-41番目にあるウリジンが、ラリアット構造とつながっているエクソン5'末端とイントロンから切り離されたエクソン3'末端の両ウリジンに結合するようである。これが接近を引き起こす。
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