結合予測のスコアリング
出典: フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』 (2021/04/02 00:52 UTC 版)
「タンパク質設計」の記事における「結合予測のスコアリング」の解説
結合は、遊離タンパク質の最低エネルギー立体配座（EP および EL）と、結合した複合体の最低エネルギー立体配座（EPL）との間のトレードオフを伴うため、タンパク質設計エネルギー関数を結合予測スコアリングに適用する必要がある。 Δ G = E P L − E P − E L {\displaystyle \Delta _{G}=E_{PL}-E_{P}-E_{L}} . K*アルゴリズムでは、自由エネルギー計算に配座エントロピーを含めることで、アルゴリズムの結合定数を近似する。K*アルゴリズムでは、遊離および結合複合体の最低エネルギー配座（P、L、PLの集合で示される）のみを考慮して、各複合体の分配関数を近似する。 K ∗ = ∑ x ∈ P L e − E ( x ) / R T ∑ x ∈ P e − E ( x ) / R T ∑ x ∈ L e − E ( x ) / R T {\displaystyle K^{*}={\frac {\sum \limits _{x\in PL}e^{-E(x)/RT}}{\sum \limits _{x\in P}e^{-E(x)/RT}\sum \limits _{x\in L}e^{-E(x)/RT}}}}
※この「結合予測のスコアリング」の解説は、「タンパク質設計」の解説の一部です。
「結合予測のスコアリング」を含む「タンパク質設計」の記事については、「タンパク質設計」の概要を参照ください。
ウィキペディア小見出し辞書の「結合予測のスコアリング」の項目はプログラムで機械的に意味や本文を生成しているため、不適切な項目が含まれていることもあります。ご了承くださいませ。
お問い合わせ。
- 結合予測のスコアリングのページへのリンク
